缺铁是炎性肠病(IBD)患者常见的并发症，但口服铁剂治疗被认为可能加重IBD症状。我们进行一项开放临床研究，比较口服铁剂治疗与静脉铁剂治疗的作用。

入选31例克罗恩病(CD)、22例溃疡性结肠炎(UC)和19例非炎性病变患者作为对照。受试者随机接受口服硫酸亚铁治疗(PO)或者静脉注射蔗糖铁剂治疗(IV)3个月，评价干预前后的临床指标、肠道菌群及代谢组学变化。

口服和静脉治疗都能改善缺铁，静脉治疗后铁蛋白水平更高。疾病的活动度与铁剂治疗方法无关。IBD的肠道菌群有明显的个体间差异，梭菌属丰度和比例降低。代谢物分析也能明显区分CD、UC和对照组。约有一半的受试者在接受铁剂替代治疗后出现明显的细菌种属的多样性转变，其中CD者最为敏感。除铁剂替代治疗可导致个体-菌种属的特异性变化外，口服铁剂治疗还引起普氏粪杆菌、布氏瘤胃球菌、多利亚芽孢杆菌和产气柯氏杆菌属的操作分类单元(operational taxonomic units，OTUs)丰度下降。代谢组学分析发现，IV和PO治疗后胆固醇代谢相关的宿主底物水平有明显的改变。

铁剂治疗可以导致IBD的肠道菌群结构和代谢产物改变。虽然临床结局类似，口服与静脉铁剂治疗对肠道菌群种属和代谢产物的改变有所不同。