病毒学
我国HIV-1 CRF07_BC流行重组毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位预测
中华微生物学和免疫学杂志, 2010,30(02) : 135-139. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2010.02.008
摘要

目的 通过测定和分析我国HIV-1 CRF07_BC毒株Tat蛋白第一外显子的基因序列预测其CTL表位的分布情况.方法236份来自第3次全国HIV分子流行病学调查中感染CRF07_BC毒株的患者的血浆样本,应用巢式聚合酶链反应(nested-PeR)扩增tat基因第一外显子基因区并测序,使用BIMASHLA Peptide Binding Predictions在线软件和统计学软件对CTL表位进行预测分析.结果236份CRF07_BC毒株来自16个省份,主要为静脉吸毒传播(58.9%),其次为性传播(25.0%).236条CRF07_BCTat蛋白第一外显子区共分布有12种CTL表位,主要分布于脯氨酸富集区、半胱氨酸富集区和疏水核心区,碱性区和谷氨酰胺富集区没有发现已知的CTL表位分布,这些表位主要受5种HLA基因型(A* 2501、A * 2902、B * 15、B * 5301和Cw * 1203)以及6种HLA血清型(B53、B58、B57、A3、A68和Cw12)限制,其中5种表位的单氨基酸变异频率大于50%.结论我国HIV-1 CRF07_BC毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位分布于不同功能区,并且存在氨基酸变异。

引用本文: 方志明, 邢辉, 孟哲峰, 等.  我国HIV-1 CRF07_BC流行重组毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位预测 [J] . 中华微生物学和免疫学杂志,2010,30( 02 ): 135-139. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2010.02.008
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