细菌学
一株血液分离的维氏气单胞菌的鉴定及系统发育分析
中华微生物学和免疫学杂志, 2019,39(5) : 370-377. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2019.05.008
摘要
目的

对一株血液分离的未知致病菌株X1进行鉴定,并对维氏气单胞菌维氏亚种、温和亚种和嗜水气单胞菌进行系统发育分析,了解维氏气单胞菌的遗传进化情况。

方法

未知致病菌X是2016年初从中南大学湘雅二医院的一位住院患者血液中分离所得,通过形态学、生理生化特性观察及聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction, PCR)检测并测序其16S rRNA的方法对X1进行最终鉴定;应用DNASP5.1对其与GenBank中相近种属进行种群间比对,并基于遗传距离构建系统发育树分析其遗传学进化情况。

结果

此未知菌株X1为革兰阴性杆菌,生化反应:氧化酶(+),葡萄糖(+),VP(+),枸橼酸盐(-);经16S rRNA基因序列分析,同源性分析表明致病株X1与气单胞菌属自然类聚(相似度97%~99%,Score: 2 170~2 149 bits),通过MEGA5.0计算发现X1与维氏气单胞菌X71120.1的遗传距离最小(0.014),但尚不能鉴定到亚种。根据该X1菌株和GenBank上已发表的气单胞菌株的16S rRNA序列进行系统发育分析,可见维氏亚种和温和亚种核苷酸歧异度和净遗传距离最小;但系统发育树却见维氏亚种单独聚为一大类,温和亚种和嗜水气单胞菌聚为另一大类。

结论

致病株X1通过形态学观察、生理生化测定、16S rRNA的同源性分析和系统发育分析鉴定为维氏气单胞菌,并丰富该菌的系统发育等方面的相关信息,了解维氏气单胞菌的进化状况。

引用本文: 张衎, 王敏, 李先平, 等.  一株血液分离的维氏气单胞菌的鉴定及系统发育分析 [J] . 中华微生物学和免疫学杂志, 2019, 39(5) : 370-377. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2019.05.008.
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气单胞菌属(Aeromonas)在自然界尤其是水环境中广泛存在,普遍分布于近海、河口地带的水生动植物和土地中。气单胞菌能感染多种动物,主要感染变温动物,某些菌种已被确认是水生生态系统中重要的病原菌,其致病范围广,可引起多种水产动物感染发病,给养殖生产带来较大经济损失[1]。而对于恒温动物,气单胞菌则是一种机会致病菌,可引起哺乳类动物和人类感染[2]。除最常引起的感染性腹泻外,气单胞菌引起肝胆疾病患者及免疫功能低下者出现肠道外感染的病例也在不断增加,病死率增高[3],这使得以往常常被忽略的气单胞菌越来越受到关注,部分国家已将其规定为食品安全的检疫对象。随着感染率的增高,耐药现象也不断出现,治疗失败率增加,所以气单胞菌感染仍应引起临床的高度重视[4,5,6]。在该属细菌中,目前研究报道较多的主要有嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila, Ahydrophila)、豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae, Acaviae)及维氏气单胞菌温和亚种(Aeromonas veronii biovar sobria, Averonii bivar sobria)等,包括这些细菌的主要特性及其所引起的水产动物和人类的病害[3,7]。而维氏气单胞菌中另一亚种维氏亚种(Aeromonas veronii biovar veronii, Averonii bivar veronii)的相关特性研究及其引起的人类感染的报道较少。2016年初本院感染科收治1名不明原因发热患者,通过血培养检测出血液中存在致病菌,结合形态学、生理生化特性、16S rRNA测序和遗传进化分析最终鉴定致病未知菌X1为维氏气单胞菌维氏亚种。鉴于维氏气单胞菌维氏亚种引起人类感染的病原菌的研究报道较少,本研究进一步分析了维氏气单胞菌的系统进化情况。

 
 
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