了解2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原流行特征,为制定监测方案和开展感染性腹泻防治工作提供科学依据。
2013年1月至2017年12月,根据地理位置、覆盖人群和就诊量,在本区3所三级医院、9所二级医院和2所社区卫生服务中心开展腹泻病原主动监测,填写门诊病例个案调查表,采集粪便样品进行5类病毒和8类细菌的病原学检测。
共纳入感染性腹泻病例9 301例,病原阳性率为55.7%(5 179)。单一病毒、单一细菌和混合感染的阳性率分别为26.7%(2 481)、17.0%(1 579)和12.0%(1 119)。单一病毒阳性病例中,诺如病毒阳性率最高(15.4%,1 428/9 301),其次为轮状病毒(7.2%,667/9 301);单一细菌阳性病例中,致泻性大肠埃希菌阳性率最高(6.7%,619/9 301),其次为非伤寒沙门菌(3.3%,305/9 301);混合感染病例中,病毒-细菌阳性率最高(4.9%,459/9 301)。诺如病毒(17.0%,838/4 938)和致泻性大肠埃希菌(7.2%,354/4 938)阳性率在20~59岁年龄组最高,轮状病毒(9.4%,178/1 896)和非伤寒沙门菌(4.9%,93/1 896)阳性率在0~4岁年龄组最高。诺如病毒年度流行呈现春季和秋季2个高峰,轮状病毒呈现冬季高峰,致泻性大肠埃希菌呈现夏季高峰,非伤寒沙门菌呈现夏季小高峰。
2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原阳性率高,诺如病毒、轮状病毒和致泻性大肠埃希菌是本地区优势病原体,病原在不同年龄组分布存在差异,优势病原季节性流行特征明显。
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感染性腹泻是一个全球性的重要公共卫生问题[1],也是≤5岁儿童死亡的第二大原因[2,3]。在我国,感染性腹泻的报告发病率一直位居法定传染病前列,造成了严重的疾病负担[4,5]。既往腹泻病原监测研究重点关注低年龄组人群及特定病原,对涵盖不同年龄组人群及多病原的连续性监测研究较少。分析2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原流行特征,为建立并完善腹泻病原长期监测和传染病精准防控提供决策依据。
2013年1月至2017年12月,根据地理位置、覆盖人群和就诊量,在本区3所三级医院、9所二级医院和2所社区卫生服务中心开展腹泻病原监测[6]。对各医院每周前3~6名符合病例定义的腹泻门诊病例进行调查和采样。病例纳入标准:24 h内腹泻次数≥3次、伴粪便性状发生改变(水样便、稀便、黏液便或血便等),腹泻持续时间≤14 d[1]。
知情同意基础上,监测点肠道门诊医生负责收集和填写病例的个案登记表。用3支无菌棉拭多点采集粪便样品,插入Carry-Blair运输培养基,进行细菌学检测;同时采集粪便样品(>5 g/ml)至无菌采样盒,进行病毒学检测。所有样品采集后24 h内送上海市浦东新区CDC微生物实验室进行13类腹泻病原检测。
参照国家腹泻症候群监测方案,对非伤寒沙门菌、志贺菌、5种致泻性大肠埃希菌[肠致病性大肠埃希菌(Enteropathogenic E. coli,EPEC)、肠产毒性大肠埃希菌(Enterotoxigenic E. coli,ETEC)、肠黏附性大肠埃希菌(Enteroaggregative E. coli,EAEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(Enteroinvasive E. coli,EIEC)与产志贺毒素大肠埃希菌(Shiga toxin-producing E. coli,STEC)]、致病性弧菌(霍乱弧菌、副溶血弧菌、拟态弧菌与河弧菌)、弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌、气单胞菌、类志贺邻单胞菌、轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒、札如病毒和星状病毒进行检测[7]。样品分别接种于木糖-赖氨酸-脱氧胆盐琼脂培养基(XLD)、麦康凯琼脂培养基(MaC)和弯曲菌琼脂培养基(Karmali)进行志贺菌、致泻性大肠埃希菌和弯曲菌分离培养,使用实时荧光定量PCR(rPCR)进行5种致泻性大肠埃希菌和弯曲菌的鉴定和分类;同时将样品分别接种亚硒酸煌绿磺胺肉汤(SBG)、碱性蛋白胨肉汤(APW)和改良磷酸盐缓冲液(PBS)增菌后,分别接种于沙门菌显色琼脂培养基、硫代硫酸盐-柠檬酸盐-胆盐-蔗糖琼脂培养基(TCBS)、气单胞菌选择性琼脂培养基(RYAN)和耶尔森菌选择性琼脂培养基(CIN)进行非伤寒沙门菌、致病性弧菌、气单胞菌、类志贺邻单胞菌和小肠结肠炎耶尔森菌的分离鉴定。分别使用志贺菌和沙门菌诊断血清对阳性株进行血清分群(型)。分别采用实时荧光定量反转录PCR(rRT-PCR)和rPCR进行病毒特异性核酸扩增。
XLD、MaC、Karmali、TCBS和RYAN琼脂培养基购自英国OXOID公司,SBG、CIN和沙门菌显色琼脂培养基购自中国上海科玛嘉微生物技术有限公司,APW和PBS购自中国上海华康生物有限公司,志贺菌和沙门菌诊断血清分别购自日本生研公司和丹麦国家血清研究所,实时荧光定量PCR试剂购自中国江苏硕世生物科技股份有限公司。实时荧光定量PCR仪为德国罗氏公司生产,检测过程中的试剂配制、仪器操作和结果判读均严格按照说明书进行,所有试剂均在有效期内使用。
①细菌学检测阳性:分离培养出目标细菌;②病毒学检测阳性:目标病毒核酸扩增阳性;③病原阳性:至少检出1种病原阳性;④单一病原阳性:仅检出一种病原阳性;⑤混合感染阳性:至少检出2种病原阳性。
采用Excel 2007软件进行数据处理,采用SPSS 16.0软件进行统计学分析。研究对象的年龄不符合正态分布,采用M(P25~P75)表示。率的比较使用χ2检验或Fisher确切概率法。双侧检验,以P<0.05为差异有统计学意义。
共纳入病例9 301例,男女性别比为1.05∶1。年龄为10 d~98岁,年龄M(P25~P75)为33(16~57)岁。见表1。
特征 | 病例数 | 构成比(%) | |
---|---|---|---|
性别 | |||
男 | 4 759 | 51.2 | |
女 | 4 542 | 48.8 | |
年龄组(岁) | |||
0~ | 1 896 | 20.4 | |
5~ | 576 | 6.2 | |
20~ | 4 938 | 53.1 | |
≥60 | 1 891 | 20.3 | |
季节 | |||
春季(3-5月) | 2 119 | 22.8 | |
夏季(6-8月) | 2 710 | 29.1 | |
秋季(9-11月) | 2 355 | 25.3 | |
冬季(12月至次年2月) | 2 117 | 22.8 | |
监测年份 | |||
2013 | 1 658 | 17.8 | |
2014 | 1 846 | 19.8 | |
2015 | 2 099 | 22.6 | |
2016 | 1 989 | 21.4 | |
2017 | 1 709 | 18.4 |
9 301例病例中,病原阳性率为55.7%(5 179)。单一病毒阳性率为26.7%(2 481)。单一细菌阳性率为17.0%(1 579)。混合感染的阳性率为12.0%(1 119)。单一病毒阳性病例中,诺如病毒阳性率最高(15.4%,1 428/9 301),其次为轮状病毒(7.2%,667/9 301)。单一细菌阳性病例中,致泻性大肠埃希菌阳性率最高(6.7%,619/9 301),其次为非伤寒沙门菌(3.3%,305/9 301),未发现STEC、痢疾志贺菌和鲍氏志贺菌病例。混合感染病例中,病毒-细菌阳性率最高(4.9%,459/9 301)。见表2。
病原 | 阳性数 | 阳性率(%) | 不同年龄组阳性率(%) | χ2值 | P值 | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0~岁 | 5~岁 | 20~岁 | ≥60岁 | |||||||
单一病毒 | 2 481 | 26.7 | 26.4 | 24.5 | 27.6 | 25.2 | 5.8 | 0.12 | ||
诺如病毒 | 1 428 | 15.4 | 11.0 | 11.3 | 17.0 | 16.8 | 48.2 | <0.001 | ||
GⅠ | 95 | 1.0 | 0.1 | 1.2 | 1.4 | 0.9 | ||||
GⅡ | 1 333 | 14.3 | 10.9 | 10.1 | 15.6 | 15.9 | ||||
轮状病毒 | 667 | 7.2 | 9.4 | 5.4 | 7.0 | 5.9 | 21.7 | <0.001 | ||
星状病毒 | 162 | 1.7 | 2.1 | 2.3 | 1.7 | 1.3 | 4.0 | 0.27 | ||
扎如病毒 | 118 | 1.3 | 1.4 | 3.3 | 1.2 | 0.6 | 25.5 | <0.001 | ||
肠道腺病毒 | 106 | 1.1 | 2.6 | 2.3 | 0.7 | 0.6 | 56.5 | <0.001 | ||
单一细菌 | 1 579 | 17.0 | 13.0 | 16.5 | 18.6 | 17.0 | 29.8 | <0.001 | ||
致泻性大肠埃希菌 | 619 | 6.7 | 5.3 | 6.6 | 7.2 | 6.7 | 7.9 | 0.05 | ||
ETEC | 294 | 3.2 | 0.3 | 1.7 | 4.0 | 4.3 | ||||
EPEC | 203 | 2.2 | 3.7 | 2.4 | 1.9 | 1.4 | ||||
EAEC | 109 | 1.2 | 1.3 | 2.1 | 1.1 | 1.1 | ||||
EIEC | 13 | 0.1 | 0.0 | 0.3 | 0.2 | 0.0 | ||||
非伤寒沙门菌 | 305 | 3.3 | 4.9 | 2.8 | 2.8 | 3.1 | 20.4 | <0.001 | ||
肠炎血清型 | 120 | 1.3 | 2.2 | 1.4 | 1.1 | 0.9 | ||||
鼠伤寒血清型 | 103 | 1.1 | 1.7 | 0.7 | 0.9 | 1.2 | ||||
其他血清型 | 82 | 0.9 | 0.9 | 0.7 | 0.8 | 1.0 | ||||
致病性弧菌 | 245 | 2.6 | 0.0 | 0.9 | 4.1 | 2.1 | 98.9 | <0.001 | ||
副溶血性弧菌 | 234 | 2.5 | 0.0 | 0.9 | 3.8 | 2.1 | ||||
其他致病性弧菌 | 11 | 0.1 | 0.0 | 0.0 | 0.2 | 0.1 | ||||
弯曲菌 | 238 | 2.6 | 1.4 | 4.0 | 2.8 | 2.7 | 16.7 | 0.001 | ||
空肠弯曲菌 | 201 | 2.2 | 1.2 | 3.5 | 2.3 | 2.4 | ||||
结肠弯曲菌 | 37 | 0.4 | 0.2 | 0.5 | 0.5 | 0.3 | ||||
气单胞菌 | 82 | 0.9 | 0.7 | 0.3 | 0.9 | 1.2 | 4.5 | 0.21 | ||
类志贺邻单胞菌 | 32 | 0.3 | 0.0 | 0.2 | 0.3 | 0.8 | 18.4 | <0.001 | ||
小肠结肠炎耶尔森菌 | 31 | 0.3 | 0.7 | 0.5 | 0.2 | 0.3 | 9.7 | 0.02 | ||
志贺菌 | 27 | 0.3 | 0.1 | 1.2 | 0.3 | 0.1 | 15.3 | 0.001 | ||
宋内志贺菌 | 22 | 0.2 | 0.1 | 0.9 | 0.3 | 0.1 | ||||
福氏志贺菌 | 5 | 0.1 | 0.0 | 0.3 | 0.1 | 0.0 | ||||
混合感染 | 1 119 | 12.0 | 11.9 | 15.1 | 12.8 | 9.3 | 20.9 | <0.001 | ||
病毒-细菌 | 459 | 4.9 | 4.6 | 5.2 | 5.5 | 3.6 | 11.4 | 0.01 | ||
病毒-病毒 | 429 | 4.6 | 5.8 | 7.1 | 4.2 | 3.7 | 19.7 | <0.001 | ||
细菌-细菌 | 231 | 2.5 | 1.5 | 2.8 | 3.0 | 2.0 | 15.7 | 0.01 |
注:ETEC:肠产毒性大肠埃希菌;EPEC:肠致病性大肠埃希菌;EAEC:肠黏附性大肠埃希菌;EIEC:肠侵袭性大肠埃希菌
诺如病毒阳性率在20~59岁组最高(17.0%),轮状病毒阳性率在0~4岁组最高(9.4%),肠道腺病毒阳性率在0~4岁(2.6%)和5~19岁(2.3%)组最高。致泻性大肠埃希菌阳性率在20~59岁组最高(7.2%),其次为60~98岁(6.7%)。非伤寒沙门菌阳性率在0~4岁组最高(4.9%)。致病性弧菌阳性率在20~59岁组最高(4.1%)。弯曲菌阳性率在5~19岁组最高(4.0%),0~4岁组最低(1.4%)。气单胞菌、类志贺邻单胞菌、小肠结肠炎耶尔森菌和志贺菌在各年龄组阳性率均较低(≤1.2%)。见表2。
病毒性病原在冬季呈现流行高峰(57.9%),细菌性病原在夏季呈现流行高峰(38.3%)。诺如病毒年度流行呈现春季和秋季2个高峰(44.0%和36.1%)。轮状病毒呈现冬季高峰(37.8%)。致泻性大肠埃希菌呈现典型的夏季高峰(24.2%),其他季节流行强度较低。非伤寒沙门菌流行强度较平稳,呈现夏季小高峰(10.3%)。见图1。
感染性腹泻主要由细菌性和病毒性病原引起,是一种在我国广泛存在并且发病率较高的肠道传染病。持续开展感染性腹泻监测能比较全面的掌握腹泻病原的流行特征,从而针对性地提出科学防控依据,对公众健康具有重要的意义。
本研究显示,上海市浦东新区腹泻病例总阳性率为55.7%,高于浙江省(37.4%)和北京市(38.7%)监测结果,与上海市(44.4%)及浦东新区既往监测结果(44.9%)接近[8,9,10,11]。与北京市细菌性病原阳性率高于病毒不同[9],本研究显示本地腹泻患者病毒阳性率高于细菌,可能与地区差异性有关。本地区腹泻病例混合感染阳性率高于浙江省(3.5%)和北京市(3.6%)监测结果[8,12],提示本地区腹泻病原构成比较复杂,需进一步研究以阐明混合感染病原在腹泻中所起的作用。20~59岁组总阳性率最高,结果与张平和张静[13]报道一致,该年龄段人群更容易接触和暴露于腹泻病原,是今后防控工作的重点人群。上海市浦东新区地处亚热带地区,夏季湿热适合细菌繁殖,秋冬季干冷适合病毒生长,因此本地区细菌和病毒性病原季节交替特征明显,结果与黎健等[10]和Wang等[7]报告一致,提示应针对不同季节开展病原防控工作。
本研究显示,诺如病毒和轮状病毒为最常见的病毒性腹泻病原,致泻性大肠埃希菌和非伤寒沙门菌为最常见的细菌性腹泻病原。病毒结果与我国其他地区,欧洲和美洲监测结果一致[14,15,16,17],提示诺如病毒和轮状病毒是我国及全球主要的腹泻病毒。细菌结果与北京市监测结果一致[18],而浙江省主要病原为副溶血性弧菌[8],广东省为非伤寒沙门菌[19],提示细菌性腹泻病原优势菌型在我国各地区流行存在差异性。本研究中优势病原在不同年份流行特征未发生重大变化,提示其持续稳定存在于本地区,是现阶段防控的重点病原。
有研究显示[17,20],轮状病毒是≤5岁儿童的主要腹泻病原,其次为诺如病毒,与本研究结果类似;不同的是,本研究显示,≤5岁儿童诺如病毒阳性率略高于轮状病毒,结果与美国的监测结果一致[21],可能与儿童接种轮状病毒疫苗从而降低感染风险有关。本研究显示,致泻性大肠埃希菌是本地区主要的细菌性病原,老龄组具有较高的阳性率,与Zhang等[22]监测结果一致。肠道腺病毒阳性率在低年龄组阳性率显著高于高年龄组,结果与我国北方地区监测结果一致[23],提示今后应加强低年龄组人群肠道腺病毒监测工作。诺如病毒流行高峰为春季和秋季,轮状病毒为冬季,致泻性大肠埃希菌为夏季,与国内外研究结果一致[17,21],这些信息为今后制定针对性的防控策略提供了依据。
本研究存在不足。未进行寄生虫病原检测,也未进行健康人群对照研究,尚不能完全揭示所有腹泻病原的流行特征。
综上所述,2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原阳性率高,诺如病毒、轮状病毒和致泻性大肠埃希菌是本地区优势病原体,病原在不同年龄组分布存在差异,优势病原季节性流行特征明显。应逐步建立多部门综合监测平台,完善腹泻病原大数据,精准防控感染性腹泻。
志谢 感谢各监测点相关人员在信息收集、样品采集和运输方面给予的大力配合;复旦大学公共卫生学院郑英杰教授和上海市CDC病原检定所许学斌副主任技师在论文撰写中给予指导和帮助
利益冲突 所有作者均声明不存在利益冲突