了解杯状病毒在昆明的分子流行病学特征,为预防和控制腹泻提供科学的参考依据。
收集云南省第一人民医院和昆明市儿童医院2014年7月至2015年6月5岁以下腹泻患儿的粪便标本321份,采用RT-PCR的方法检测杯状病毒,并选取部分阳性扩增产物经序列测定分析其基因型。
321份粪便标本中HuCV的阳性率为10.59%(34/321),感染无明显的季节性,检出率在患者性别和年龄组间的差异均无统计学意义;34份HuCV阳性标本中以NoV为主,占94.12%(32/34),其中绝大多数为GⅡ型(31/32,96.88%),仅1株为GⅠ型;SaV共2株,占5.88%(2/34),分别为GⅠ型和GⅡ型。
HuCV是昆明地区5岁以下腹泻患儿的重要病原体之一,GⅡ.4/Sydney2012株是流行优势株。
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人杯状病毒(Human calicivirus, HuCV)是引起儿童和成人非细菌性急性胃肠炎的重要病原,在世界各地都有广泛传播。它分为诺如病毒(Norovirus, NoV)和札如病毒(Sapovirus, SaV)两个属。根据病毒抗原性和核苷酸序列的多样性,目前将诺如病毒和札如病毒分别划分为三个遗传组,每一遗传组依据叔丁基-4-羟基茴香醚(BHA)多聚酶及衣壳蛋白区域序列的差异,可进一步划分为不同群或基因型[1]。其中NoV分为五个基因群:GⅠ、GⅡ、GⅢ、GⅣ和GⅤ,GⅠ、GⅡ(除NV SⅡ/GⅡ可感染猪外)和GⅣ群诺如病毒感染人类,GⅢ和GⅤ则分别在家畜和老鼠体内发现;近年来,分子流行病学研究表明,70%的诺瓦克病毒暴发是由GⅡ.4不同的变体引起的[2]。SaV也分为5个基因型(GⅠ,GⅡ,GⅢ,GⅣ,GⅤ),GⅠ型、GⅡ型、GⅣ型和GⅤ型病毒主要感染人,GⅢ型病毒主要感染猪[3],其中GⅠ型分布广,较常见。本研究对昆明地区2014年7月至2015年6月就诊于云南省第一人民医院和昆明市儿童医院的321份门诊腹泻患儿的粪便标本进行鉴定和分型,旨在了解昆明地区腹泻患儿中HuCV的分子流行病学特点。