范丽霞; 王卫军; 巴卓玛; 赵生仓; 李崇亥; 姜双应; 严冬梅; 冀天娇

doi:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2018.05.011

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青海省2016—2017年人肠道病毒A组71型基因特征

中华实验和临床病毒学杂志, 2018,32(5) : 501-504. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2018.05.011

摘要

目的

对青海省2016—2017年手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)人肠道病毒A组71型(human enterovirus group A type 71, EV-A71)的基因特征进行分析。

方法

对青海省2016—2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)方法进行筛查，对EV-A71阳性标本进行病毒分离，对分离到的病毒提取核酸，用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析，并与EV-A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。

结果

青海省2016—2017年共分离到114株EV-A71，均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示，又进一步分属2个不同的小分支。2016—2017年青海省流行的不同传播链上EV-A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。

结论

青海省2016—2017年流行的EV-A71以C4a为绝对优势基因亚型，未监测到其他基因型病毒。青海省EV-A71不是独立进化的，而是与我国其他地区流行的EV-A71共同进化。

引用本文: 范丽霞, 王卫军, 巴卓玛, 等. 青海省2016—2017年人肠道病毒A组71型基因特征 [J] . 中华实验和临床病毒学杂志, 2018, 32(5) : 501-504. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2018.05.011.

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手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)是由肠道病毒(human enterovirus, HEV)引起的传染病，其中以肠道病毒A组71型(human enterovirus group A type 71，EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, CV-A16)感染最为多见。自1974年Schmidt等^[1]首次报道以来，全世界很多国家和地区先后报道了EV-A71的感染和流行情况^[2,3]。近10年的流行病学研究显示，全球各地HFMD暴发流行主要是由EV-A71引起^{[4,5,6,7,8,9]}。青海省从2008年开始，每年对EV－A71的流行情况进行监测，实验室数据显示2012、2013、2015和2017年以EV-A71为优势病毒株，实验室核酸检测阳性标本中EV-A71所占的比例分别为93.71%、65.52%、40.81%和42.15%。本文对2016—2017年青海省HFMD的主要病原体EV-A71的基因特征进行分析，加强对EV-A71的分子流行病学监测，了解EV-A71的基因特征，对预防和控制EV-A71的暴发具有重要意义。

贡献者信息

范丽霞

810007　西宁，青海省疾病预防控制中心卫生检验检测中心

王卫军

810007　西宁，青海省疾病预防控制中心卫生检验检测中心

巴卓玛

810007　西宁，青海省疾病预防控制中心卫生检验检测中心

赵生仓

810007　西宁，青海省疾病预防控制中心卫生检验检测中心

李崇亥

810007　西宁，青海省疾病预防控制中心卫生检验检测中心

姜双应

810007　西宁，青海省疾病预防控制中心卫生检验检测中心

严冬梅

102206　北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

冀天娇

102206　北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

通信作者

冀天娇

102206　北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

Email：360646322@qq.com

关键词

手足口病; 人肠道病毒A组71型; C4a基因亚型;

基金项目

国家科技重大传染病监测技术平台项目（2012ZX10004—208）

利益冲突

利益冲突　无

历史

出版日期：2018-10-30

收稿日期：2018-03-22

本文编辑

吕新军

Original Article

Genetic characteristics of human enterovirus A type 71 in Qinghai province during 2016-2017

Lixia Fan, Weijun Wang, Zhuoma Ba, Shengcang Zhao, Chonghai Li, Shuangying Jiang, Dongmei Yan, Tianjiao Ji

Published 2018-10-30

Cite as Chinese J Exp Clin Virol, 2018, 32(5): 501-504. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2018.05.011

Abstract

Objective

To investigate the genetic characteristics of enterovirus A 71 (EV-A71) and etiological features of hand, foot and mouth disease (HFMD) in Qinghai province from 2016 to 2017.

Methods

Specimens were collected from HFMD patients in Qinghai province, and detected by real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). For EV-A71 positive samples, virus was isolated and RNA was extracted, and then VP1 coding region was amplified by RT-PCR. The phylogenetic tree was constructed by comparing with other genotypes and sub-genotypes strains of EV-A71.

Results

It was shown that 114 strains of EV-A71 were isolated in Qinghai province from 2016 to 2017, which all belonged to genotype C4a, and could be divided to two different lineages by phylogenetic analysis. From 2016 to 2017, the epidemic strains of EV-A71 in the different transmission chains of Qinghai province was closely related to other provinces of China.

Conclusions

C4a was the dominant genotype of EV-A71 in Qinghai province from 2016 to 2017, and no other genotype was detected. In addition, EV-A71 isolated from Qinghai province co-evolved with EV-A71 in other provinces of China.

Key words:

Hand, foot and mouth disease; Human enterovirus group A type 71; Subgenotype of C4a

Contributor Information

Lixia Fan