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基于高通量技术的SFTS病毒基因组测序方法的建立
中华实验和临床病毒学杂志, 2019,33(1)
: 89-94. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2019.01.020
摘要
目的
建立一种基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus，SFTS)基因组的测序方法。
方法
提取SFTS病毒核酸，分别采用随机引物和oligo(dT)磁珠特异性抓取核酸的方法，优化扩增和纯化条件并建库，利用二代测序仪检测病毒核酸序列。
结果
3株病毒采用两种方法测序结果差距较大，利用随机引物建库法获得的数据测序深度和覆盖度明显低于oligo(dT)磁珠抓取建库法。采用oligo(dT)磁珠抓取建库的方法，可对提取的核酸大于300ng的毒株进行测序，3株病毒测序深度都在900以上，覆盖度均超过99%，与NCBI上数据匹配度在90%以上。
结论
利用oligo(dT)磁珠抓取SFTS病毒核酸的方法进行建库，建立了基于二代测序平台的SFTS病毒基因组检测方法。
引用本文:
俞维维,
孙逸,
颜浩,
等.
基于高通量技术的SFTS病毒基因组测序方法的建立
[J]
. 中华实验和临床病毒学杂志, 2019, 33(1)
: 89-94.
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2019.01.020.
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