对济南市2017年手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病原中的柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, CV－A16)分离鉴定，分析VP1基因遗传进化特征。
整理分析2017年济南市HFMD监测样本，采用简单随机抽样方法选取CV-A16核酸阳性样本经预处理后接种人横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma, RD)细胞，对产生明显细胞病变效应的毒株进行鉴定，测定VP1基因序列，应用MEGA5.2软件构建系统进化树，通过Lasergene软件对VP1进行核苷酸及氨基酸同源性分析。
通过细胞分离获得10株CV-A16阳性病毒株，均属B1b亚型，分别位于3个不同簇，核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.9%～100%和99.3%～100%，与我国CV-A16上海株(KX871333)(同源性99.7%)、河南株(KM260134)(99.0%)、江苏株(KP751580、KR138327)(98.7%)及广东株(MH004016)(98.5%)亲缘关系较近。与国内参考株相比，济南市CV-A16分离株VP1存在N14S、S59R、E145V变异。
CV-A16病毒株B1b基因亚型为济南市优势毒株，VP1蛋白发生氨基酸变异。
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手足口病(hand, foot, and mouth disease, HFMD)是导致婴幼儿，尤其是5岁以下儿童感染的主要传染病之一，通常症状较为温和，主要表现为发热伴手、足、臀部等多部位皮疹，个别重症者累及中枢神经系统及心肺系统，严重者导致死亡[1]。引起HFMD的病原体有20多种，其中肠道病毒71型(enterovirus 71, EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, CV-A16)为最主要病原体。我国HFMD监测网络数据显示，2008年至2015年共1 370万人感染，在实验室确诊病例中，由EV-A71引起的感染占43.6%，CV-A16其次，占24.9%[2]。济南市HFMD病原分析结果显示CV-A16占感染总数的37.22%，略高于EV-A71(33.67%)[3]。与EV-A71感染相比，CV-A16通常不引起严重的中枢神经系统相关疾病，重视程度及研究深度均不及EV-A71[4]。但近年来调查结果显示，在对广西、上海、江西及山东等地HFMD重症及/或死亡病例病原分析中，CV-A16均占不同程度比例，是除EV-A71外的主要病原体[5,6,7,8]，另外，随着EV-A71灭活疫苗在我国的推广应用，也要重视CV-A16对HFMD流行状况的影响。
