对云南省2010—2013年病毒性脑膜炎(viral meningitis，VM)病例中分离到的9株埃可病毒30型(echovirus 30, E-30)VP1编码序列基因特征进行分析。
对云南省2010—2013年VM病例中分离到的9株E-30病毒的VP1区进行基因扩增和测序；从GenBank下载E-30病毒参考株(reference)和原型株(prototype)VP1编码序列作为参考序列，用MEGA5.1软件计算9株病毒之间及它们与原型株和参考株之间的核苷酸(nucleotide，nt)和氨基酸(amino acid，aa)差异率，并构建系统进化树，进行VP1编码序列基因特征和分子流行病学分析。
2010—2013年云南省从553例VM病例中共分离到79份肠道病毒(enterovirus，EV)，其中E-30病毒9株，占11.39%(9/79)，E-30的阳性检出率为1.63%(9/553)。基因特征分析表明，E-30病毒可分为A、B、C、D基因型(genotype)，D基因型又分为7个亚型，本次云南的E-30病毒分离株均为D7基因亚型(sub-genotype D7), 9株病毒分布在3个不同的进化分支中。其中，5株2010年7月下旬分离到的病毒形成1个单独的进化分支，结合流行病学分析，这些病毒株可确定为引起当年昆明市周边地区一起E－30 VM暴发流行的病因；2011年的1株E－30病毒和2013年分离株与2010年云南省边境健康儿童分离株共同形成了第2个进化分支，3株E－30病毒之间亲缘较近，具有同一进化来源，以上2个分支均为云南省特有的进化分支；2011年的另外2株病毒则和2003年中国山东、江苏、浙江省VM暴发流行时分离到的病毒形成了第3个进化分支，这些病毒株可能具有同一进化来源。
本次云南的9株E-30病毒分离株均为D7基因亚型，但9株病毒具有不同的进化来源，可见不同时间E-30病毒的同一基因亚型进化分支可在不同地区间流行。
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人类埃可病毒30型(echovirus 30, E-30)属小核糖核酸病毒科肠道病毒属，属于人类肠道病毒(enterovirus, EV)B组病毒中的1个血清型，是一种无胞膜病毒，能在恶劣的环境条件(如高盐、高pH值和37 ℃)下稳定存活。E-30是病毒性脑膜炎(viral meningitis，VM)的常见病原体之一[1]。过去20年中，国内外多次报道了由E-30引起的VM暴发流行，如日本[2]、巴西[3]、欧洲[4]、意大利[5]、法国[6]，中国[7,8,9]等。由于EV VP1区基因上有病毒血清型特异性中和位点，因此基于对VP1区基因进行测序定型已广泛用于EV的基因定型[10,11]和分子流行病学分析。本研究对2010—2013年云南省VM病例中分离到的9株E-30病毒的VP1全区进行序列测定和分析。
