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西宁市2017—2018年柯萨奇A16型肠道病毒VPl基因分子特征分析
中华实验和临床病毒学杂志, 2019,33(5)
: 482-484. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2019.05.008
摘要
目的
对西宁市2017—2018年手足口病(hand，foot and mouth disease，HFMD)人肠道病毒柯萨奇A16型(Coxsackievirus A16，CV－A16)的VPl基因特征进行分析。
方法
对西宁市2017—2018年送检的HFMD标本，用荧光定量PCR方法检测，对CV-A16阳性标本进行病毒分离，对分离到的病毒提取核酸，用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析，并与CV-A16各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。
结果
西宁市2017—2018年共分离到70株CV-A16，2017年西宁市流行的10株CV-A16可以被划分为2个基因亚型，其中3株为B1a基因亚型7株为B1b基因亚型。而2018年CV-A16流行株则只有B1b基因亚型。
结论
西宁市2017—2018从手足口病病例分离到的CV-A16病毒有B1a与B1b两种基因亚型，共同进化与流行，其中B1b基因亚型为主要流行株。
引用本文:
耿海杰,
任丽萍,
封永建,
等.
西宁市2017—2018年柯萨奇A16型肠道病毒VPl基因分子特征分析
[J]
. 中华实验和临床病毒学杂志, 2019, 33(5)
: 482-484.
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2019.05.008.
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