遗传病是指由遗传物质发生改变或致病基因所控制的疾病，其具有先天性、终身性和家族性的特征，是导致新生儿出生缺陷的主要因素。《中国出生缺陷防治报告(2012)》指出，我国出生缺陷发生率约为5.6%，每年新增出生缺陷患儿约90万例^[1]，出生缺陷是造成儿童残疾的重要原因，也是婴幼儿死亡的主要原因。目前我国通过多种新生儿疾病筛查技术对未出现临床症状的遗传病患儿进行早期诊断和治疗，有效降低了患儿的伤残率和病死率，极大减少了出生缺陷对家庭和社会造成的严重危害^[2,3,4,5]。近十几年，随着分子生物学技术和基因组学的飞速发展，基因检测技术已成为多数遗传病诊断的金标准，尤其在生化或酶学方法无法作出诊断，检测结果不明确的情况下，基因检测是重要的确诊手段，但在新生儿遗传病筛查领域，基因检测技术尚未成熟应用，我国多见新生儿耳聋基因筛查逐步开展的报道^[6,7,8]。对新生儿常见遗传病进行基因筛查，具有极大挑战，目前很多基因变异位点的致病性尚不明确，且健康个体都可能会携带几个甚至十几个致病性变异位点，如何确定是否发病，何时开始干预，如何进行遗传咨询都是基因筛查面临的问题。复旦大学附属儿科医院周文浩教授团队率先在国内大规模开展新生儿基因筛查研究，取得了一系列重大发现，但由于亚全外显组测序费用较高，因此，本研究筛选新生儿常见遗传性疾病相关的138个致病基因制成捕获芯片，通过高通量测序技术对新生儿进行基因筛查，以了解广东地区新生儿常见遗传病发病率及相关基因致病变异的携带率及变异情况，并探讨基因检测技术在新生儿遗传病筛查中的应用价值。

新生儿疾病筛查是在新生儿人群中进行的主动检测，以期在新生儿出现症状之前尽早发现和诊断可治疗、可干预的疾病，其筛查的疾病多为遗传性疾病。随着筛查技术的发展，我国新生儿筛查的疾病种类越来越多，目前常用的方法包括荧光免疫法、酶免疫法、时间分辨荧光免疫分析法、串联质谱技术等，筛查技术也从一次实验检测一种疾病发展到一次实验检测多种疾病，实现了新生儿筛查的重大突破。但目前新生儿疾病筛查仍存在一些问题，如酶免疫法筛查时，比较费时且多为半定量结果；串联质谱检测技术用于遗传代谢病筛查，其可检测多个病种，且速度快、成本低，但存在一定假阳性率，且一些迟发型的遗传病不能被检出，甚至有些患儿在检测结果出来前已经死亡，未及时保存基因标本进行检测。因此新生儿疾病筛查技术仍需不断的改进和发展。随着分子生物学技术和基因组学的飞速发展，基因检测技术为多数遗传病的疾病诊断提供了非常重要的确诊途径，其检测精度越来越高，检测费用越来越低，这使基因检测技术对新生儿进行基因筛查成为可能，此外，基因检测技术可根据实际需求灵活设计检测的基因数量，可使新生儿筛查的范围更科学、更全面，目前国内外均有使用基因检测技术进行新生儿遗传病筛查的报道^{[10,11,12,13,14,15,16]}，其研究结果均令人满意，但也面临着新的挑战，如怎样确定筛查的基因、未知变异位点的致病性如何确定、携带致病性变异位点的个体是否发病、基因筛查阳性患儿若无临床表型如何治疗和干预、对基因筛查的个体如何进行遗传咨询等。

本研究筛选新生儿常见的遗传性疾病相关的138个致病基因制成捕获芯片，通过高通量测序对1 793例新生儿进行遗传病基因筛查。结果显示，共筛查出阳性158例，阳性率为8.81%；携带1个或多个基因致病变异位点共972例，携带率为54.21%，提示新生儿常见遗传性疾病的致病变异在广东地区有较高的发病率和携带率。研究显示，在携带率较高的疾病中，均有高频变异位点出现，该结果提示UGT1A1基因c.211G>A位点、GJB2基因c.109G>A位点、SLC10A1基因c.800C>T位点是广东省地区人群的高频变异位点，这与相关研究结果^[17,18,19]一致。

常染色体隐性耳聋1A型的致病基因为GJB2基因，本研究发现41例阳性结果中，有39例因c.109G>A位点纯合变异引起；此外，在302例常染色体隐性耳聋1A型的携带者中，有287例c.109G>A位点杂合变异，提示c.109G>A位点是常染色体隐性耳聋1A型发病的高发位点，其人群携带率为16.00%，这与国内多项研究结果基本一致^[20,21]。研究表明，c.109G>A位点纯合变异只可导致轻度或中度的耳聋，且一部分纯合变异者无听力损失的症状，因此该位点在临床上的致病性一直颇有争议，2019年ClinGen听力损失专家小组收集多家机构共享的数据，对每个证据进行严格审查，最终判定c.109G>A位点为"对具有可变表达性和年龄依赖性外显率的常染色体隐性非综合征性听力损失具有致病性"^[22]。GJB2基因纯合变异的患儿可能在出生时耳聋，也可能为迟发性耳聋，3岁前可以大致正常，随着年龄增长可慢慢出现耳聋症状，也有部分患儿不出现耳聋症状，所在做遗传咨询时，建议患儿家属对患儿进行长期密切的听力监测，定期检查耳声发射和听性脑干反应，出现异常及时进行干预，本研究检测阳性患儿中出现出生后2次听力检测均通过，第3次检测未通过，提示密集定期听力监测对常染色体隐性耳聋1A型阳性患儿有重要意义。

此外，本研究将钠牛磺胆酸共转运多肽缺陷病的致病基因SLC10A1的c.800C>T位点纳入新生儿遗传病筛查，该症以婴幼儿期显著而持续性的高胆汁酸血症为主要临床特征，在新生儿期高胆红素血症和婴儿早期胆汁淤积症的基础上出现显著而持续性的高胆汁酸血症，c.800C>T位点的纯合变异可严重影响钠牛磺胆酸共转运多肽对胆酸和牛磺胆酸的摄取功能，从而导致持续高胆汁酸血症。虽然在美国医学遗传学与基因组学学会(the American College of Medical Genetics and Geno-mics，ACMG)指南中c.800C>T位点的致病性被定义为意义未明，但越来越多的临床研究证实该变异是一个可影响胆汁酸摄取功能的致病性变异^[23,24,25]。在1 793例样本中，本研究共发现由c.800C>T位点引起的18例阳性和291例携带者，其阳性率和携带率分别为1.00%、16.22%。有研究显示中国、韩国和越南人群中SLC10A1基因的c.800C>T位点携带率分别达到了7.4%、3.1%和9.2%，并且在广州市人群中高达10.9%^[19,26]，本研究结果与之相似。研究显示该变异的等位基因频率具有明显种族差异，在非裔/欧裔美国人和西班牙语人群中携带率极低，而在东亚人群频率较高^[19]。因为该症患儿通常预后良好，迄今未发现因本病出现死亡或肝硬化等严重预后的报道，所以本研究将SLC10A1基因的c．800C>T位点纳入新生儿遗传病筛查，主要是为了解释部分伴有显著而持续性高胆汁酸血症的新生儿高胆红素血症、婴儿早期胆汁淤积症患者的病因，避免医师和家属因为不清楚高胆汁酸原因而采用肝脏穿刺等创伤性检查和过度治疗，对患儿造成的伤害。

本研究结果还发现，一些基因的变异位点在广东地区人群具有特异性，在1 793例样本中，共发现10例携带甲基丙二酸尿症合并同型半胱氨酸尿症cblC型的MMACHC基因变异，其变异位点均为c.609G>A或c.658_660delAAG；9例携带高脯氨酸血症Ⅰ型的PRODH基因变异，其变异位点均为c.1322T>C；7例携带短链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症的ACADS基因变异，其变异位点均为c.1031A>G；5例携带黏多糖贮积症ⅢB型的NAGLU基因变异，其变异位点均为c.1562C>T；5例携带肉碱-酰基肉碱转位酶缺乏症的SLC25A20基因变异，其变异位点均为c.199-10T>G，这些基因变异位点在人群的携带率相对较低，但是具有高度的特异性。这些疾病中，肉碱-酰基肉碱转位酶缺乏症、甲基丙二酸血症mut型、高脯氨酸血症Ⅰ型等均可引起新生儿死亡，广东省多起新生儿猝死导致的医疗纠纷经过基因和代谢分析最终表明是肉碱-酰基肉碱转位酶缺乏症患儿；甚至有个别家庭连续死亡5例患儿才最终查明该病致病的原因，教训惨痛。因此有必要进行人群大样本的基因筛查统计，特别是不明原因突然死亡的新生儿要尽量进行全面的家系全外显组测序和基因拷贝数变异(CNV)分析以明确病因，一方面可减少医疗纠纷；另一方面可查明原因，通过第3代试管婴儿技术避免同样悲剧的发生。统计这些特异性位点的人群携带率，也有助于判断是否需要进行已经怀孕或者准备怀孕人群携带者筛查以降低相关致死性疾病患儿的出生。

综上所述，本研究通过基于目的基因捕获的高通量测序技术对新生儿常见遗传病进行基因筛查，初步研究结果显示了广东地区常见遗传病的人群携带率和变异类型，并提示该地区高发遗传病为常染色体隐性耳聋1A型、Gilbert综合征或Crigler-Najjar综合征、G6PD缺乏症、家族性高胆固醇血症和钠牛磺胆酸共转运多肽缺陷病，这为相关疾病人群筛查或者预防提供了理论依据。此外，此次筛查也发现了158例阳性患者，这为遗传病早诊断、早治疗提供了可靠的分子诊断依据，体现了该技术在新生儿遗传病筛查中的应用价值。