早发癫痫性脑病(early onset epilepticencephalopathy，EOEE)指一组在婴儿期起病的难治性癫痫，由于频繁的癫痫发作或癫痫放电导致严重认知和行为障碍、精神运动发育迟缓；包括早期肌阵挛脑病、大田原综合征、婴儿癫痫伴游走性局灶性发作、婴儿痉挛症(IS)、Dravet综合征、非已知的癫痫性脑病等^[1]；EOEE是预后最差的癫痫性脑病，基因突变是EOEE的重要病因^[1]。基于此，本研究结合全外显子和全基因组拷贝数变异测序(copy number variations sequencing，CNV－seq)技术对60例不明原因的EOEE患儿进行基因变异检测，以期早期确诊及进行癫痫精准治疗。

基因与CNV是EOEE的重要潜在病因^[4]。本组资料60例EOEE患儿基因诊断明确24例(40.0%)，其中单基因变异20例(33.3%)，CNV变异4例(6.7%)，检测结果与既往报道基本符合^[5]；共检出13种单基因变异，其中15处变异位点和5种CNV变异既往国内外文献均未见报道。IS是婴幼儿期最常见的年龄特异性癫痫性脑病，本资料中10例IS患儿有3例存在TSC基因变异，例1同时存在TSC1、TSC2突变，胞姐是TSC1杂合变异，均遗传自父亲；其父仅面部有皮脂腺瘤，姐姐表型正常，同时存在TSC1、TSC2突变文献报道十分少见；3例患儿诊断结节性硬化症(TSC)临床标准均不足，均通过基因确诊，TSC是最常引起IS的神经皮肤疾病。

本研究中与IS相关的基因还有SCN8A、ZEB2、HNRNPU、DCX等，其中SCN8A基因以新发变异为主，极少数遗传，表型异质性强^[6]。例9患儿9月龄时出现痉挛发作，起病前发育正常，起病后发育轻度落后，脑电图可见高峰失律，确诊IS，行全外显子联合CNV检测出系SCN8A基因杂合错义突变，遗传自有癫痫病史的父亲，其父幼年起病，语言表达稍差，智力大致正常，目前同时服用卡马西平和拉莫三嗪，偶有发作。

ZEB2基因突变可导致Mowat-Wilson综合征(MWS)，表现为难治性癫痫、发育落后、特殊面容、多脏器畸形、先天性巨结肠症等^[7]；由于基因的大片段缺失、移码或无义变异导致单倍体剂量不足而致病，错义突变少见^[8]。例15系ZEB2基因新生无义突变(c.2456C>G，p.Ser819X)，表型为IS，ZEB2变异导致IS十分少见，本例是国内首次报道。

例20为HNRNPU移码突变(p.Arg224Glyfs*11)，是23个碱基对缺失的结果，最终导致翻译提前终止。HNRNPU基因的大片段缺失与智力低下和癫痫发作相关，目前国内外报道大部分为染色体片段微缺失部分含有该基因缺失，资料中例23就检出2处CNV异常，即1q43-1q44缺失和Xp22.339重复，缺失区域包括EOEE的致病基因HNRNPU；患儿表现为精神发育迟滞、特殊面容、小角膜、胼胝体异常等，与文献报道^[9,10]相符。HNRNPU基因点突变少见，几乎所有患儿均在出生1年内起病，多有热敏感性，表现为痉挛发作，大多早期有精神运动发育落后。

DCX为X连锁基因，此类基因变异对男女患者的影响不同。女性DCX基因变异表现为典型的双皮质综合征，男性则为无脑回畸形^[11]；女性患病与X染色体随机失活有关；男性表型更重，早期出现严重的认知、语言障碍和癫痫发作等症状^[12]。例14系DCX基因错义突变女性患儿，表型为IS、皮质下层状灰质异位。资料中与X连锁相关的基因还有CDKL5、PCDH19，CDKL5基因变异女性患病率高，男女表型严重程度无明显差异^[13]。例11女童系CDKL5基因新发移码突变(c.1993_1996del)，出生1个月出现癫痫发作，发作频繁、多种发作形式，6个月时不会追光追物、不会抬头、仅发声。研究发现^[13]CDKL5相关IS患儿接受促皮质素(ACTH)治疗后易出现频繁惊厥发作，此类患儿应慎用ACTH。

另外在诊断为非已知癫痫性脑病的患儿中发现存在PPP3CA基因突变，目前国内未见相关报道，该基因突变导致婴儿或儿童早期癫痫性脑病1型^[14]；例16系PPP3CA基因新发杂合移码缺失(c.1255_1256delAG)，患儿2个月时出现癫痫发作，包括局灶性、阵挛性、全面性强直阵挛等多种发作形式，目前4岁，不会说，不会抬头，仅发声、没有语言，肌张力低，预后很差。例17系CACNA1E基因错义突变，表型为难治性癫痫、严重肌张力减退及发育落后。CACNA1E功能获得性变异是导致EOEE的主要原因^[15]，阻断R型钙电流是开发CACNA1E相关癫痫精准药物的一个有希望的靶点。

除外以上的单基因变异，还发现4例CNV变异患儿，主要表型包括精神运动发育迟滞、特殊的颅面特征、多脏器畸形、难治性癫痫等。例21系17p13.3缺失，内含LIS1等基因，LIS1缺失可导致Miller-Dieker综合征(MDS)^[16]，该患儿有发育落后、肌张力异常、无脑回畸形、IS等，符合MDS^[16]。例22系11q23.3q25缺失，缺失区域中的FLI1基因参与血管和巨核细胞的分化，缺失可导致血小板减少，该患儿表现为发育落后、IS、血小板减少等；此综合征还可有癫痫发作，但表型为IS系首次报道^[17]；例23缺失区域包括EOEE的致病基因HNRNPU。例24系与1p36缺失综合征相关，此类缺失综合征多数有癫痫发作，以IS最常见^[18]。该患儿表型为追光追物差、癫痫、手指畸形等。除病例23外，其余3例均缺乏典型的颅面部特征考虑与年龄小有关。

传统方法如临床症状、头颅MRI和遗传代谢检测等对癫痫性脑病的病因诊断率<13%，二代靶向测序可将诊断率提高至30%左右^[19]。本研究联合全外显子和CNV对EOEE进行检测，基因变异阳性率33.3%，CNV阳性率6.7%，总阳性率达40.0%；联合CNV检测可提高EOEE病因的检测阳性率，与既往文献报道一致^[5,19,20]。一项回顾性文献报道显示，癫痫性脑病患儿的起病年龄(27.23±44.05)个月(7 d~15岁)，均通过基因检测确诊，确诊年龄(6.8±4.7)年(5个月~17岁)^[19]；本研究中患儿就诊年龄2 d~4岁(中位年龄10个月)，就诊后立即进行基因检测，检测耗时20个工作日，患儿的确诊年龄可控制在就诊1个月以内，即1个月~4岁1个月(中位年龄11个月)，确诊年龄明显小于上述报道年龄。另有研究显示，早期对EOEE患者进行基因测序，不仅可将诊断年龄提前，并有助于早期精准治疗、减少医疗支出，具有显著的临床效益和成本效益^[21]。本研究连同上述文献报道为基因测序在EOEE早期诊断中的临床应用价值提供了有力的证据。

本研究对不明原因EOEE联合采用全外显子组和CNV－seq技术检测，丰富了EOEE的基因型，提高了EOEE的病因诊断水平；对这类患儿早期进行遗传学检测，可以早期确诊，避免不必要的后续检查并有助于癫痫精准治疗、判断预后及再生育指导。