探讨赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1(lysine-specific demethylase 1, LSD1)对结肠癌细胞侵袭转移能力的影响及其机制。
利用RNAi技术和单胺氧化酶抑制剂(Pargyline)在体外抑制结肠癌细胞(SW620)中LSD1的表达,采用MTT细胞增殖实验、Transwell细胞侵袭实验、FCM细胞凋亡实验检测抑制LSD1的表达对结肠癌细胞SW620增殖、侵袭、凋亡的影响。
体外合成了三段siRNA序列(siRNA-1554、siRNA-705、siRNA-1973),经检测siRNA-705的沉默效率最高。利用siRNA-705和单胺氧化酶抑制剂体外干预SW620细胞,能明显抑制SW620细胞的增殖、侵袭和转移能力,并能诱导细胞凋亡。同时我们发现,使用siRNA-705和单胺氧化酶抑制剂处理72 h后,结肠癌细胞的E钙黏蛋白的表达水平明显上调,N钙黏蛋白的表达水平明显下调(P<0.05)。
体外抑制LSD1的表达能抑制结肠癌细胞的增殖、侵袭转移能力,诱导细胞凋亡,并能上调E钙黏蛋白的表达,下调N钙黏蛋白的表达,三者可能在结肠癌的侵袭转移过程中发挥了重要作用。






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结肠癌的发病率整体呈上升趋势,是第三常见的恶性肿瘤,死亡率第四位,转移是导致结肠癌患者死亡的主要原因[1]。目前普遍认为,上皮间质转化(EMT)在癌症转移的起始中发挥重要作用,在此过程中,上皮细胞获得成纤维细胞样特性,细胞极性消失,细胞间黏附作用减退,侵袭和运动能力增强。赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1(LSD1)在转录因子Snail/Slug介导的上皮间质转化过程中不可或缺,没有LSD1的参与,Snail将不能有效抑制E钙黏蛋白的表达[2]。LSD1是第一个被发现的组蛋白特异性去甲基化酶,过表达LSD1能促进多种肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移[3,4],但其是否与结肠癌的转移相关尚待检验。本研究利用RNAi技术和单胺氧化酶抑制剂(Pargyline)在体外抑制结肠癌细胞(SW620)中LSD1的表达,采用MTT细胞增殖实验、Transwell细胞侵袭实验、FCM细胞凋亡实验检测抑制LSD1的表达对结肠癌细胞SW620增殖、侵袭、凋亡的影响。
结肠癌细胞SW620细胞购自美国模式培养物集存库(ATCC)。LSD1、E-cadherin、N-cadherin、GAPDH兔抗人单克隆抗体购自美国R&D公司,Pargyline购自美国Epigentek公司,HRP标记的羊抗兔IgG购于美国SANTA CRUZ公司,LSDl、E-cadherin、N-cadherin基因,内参照GAPDH引物由上海吉玛生物公司合成。
在GenBank中检索出人源LSD1序列(NM_001009999.2),其FASTA格式序列为:>gi|226437585|ref|NM_001009999.2| Homo sapiens lysine (K)-specific demethylase 1A (KDM1A), transcript variant 1,mRNA。按照siRNA设计原则,设计siRNA序列(表1)。

siRNA引物序列
siRNA引物序列
序号 | 代码 | 序列 |
---|---|---|
1 | LSD1-homo-1554 | 正义链5′ GCCACCCAGAG AUAUUACUTT 3′ |
反义链5′ AGUAAUAUCUC UGGGUGGCTT 3′ | ||
2 | LSD1-homo-705 | 正义链5′ CCGGAUGACU UCUCAAGAATT 3′ |
反义链5′ UUCUUGAGAAG UCAUCCGGTT 3′ | ||
3 | LSD1-homo-1973 | 正义链5′ CCACGAGUCA AACCUUUAUTT 3′ |
反义链5′ AUAAAGGUUU GACUCGUGGTT 3′ | ||
4 | LSD1 negative | 正义链5′ UUCUCCGAAC GUGUCACGUTT 3′ |
反义链5′ ACGUGACACG UUCGGAGAATT 3′ |
将以上Target sequence交给上海吉玛制药技术有限公司,构建成LSD1基因的siRNA表达载体(PGCsi3.0-LSD1-siRNA),并构建Control siRNA作为阴性对照。质粒制备完成后进行细胞转染。
Transwell小室的PVPF膜上预先铺上基质胶,于37 ℃放置2 h,室温过夜后在Transwell下室加入1 ml RPMI1640培养基[(含10%胎牛血清(FBS)],取2 ml细胞悬液加入到Transwell的上室。取出Transwell趋化板,将其置于37 ℃的CO2孵育箱中孵育。12 h后取出PVPF膜,擦去基质胶和Transwell上室内的细胞,用95%乙醇固定Transwell下室内的细胞约30 min,结晶紫染色20 min。随机选取10个视野,于倒置相差显微镜下(10×20)观察、计数并照相。
将细胞培基吸至离心管内,胰酶消化,用PBS缓冲液冲洗贴壁细胞,使细胞重悬浮。使用Binding缓冲液将细胞稀释至106/ml。取100 μl已重悬浮的细胞(105个细胞)至5 ml的培养管,加入195 μl膜连蛋白-异硫氢酸荧光素结合液并轻摇,使细胞重新悬浮。加入5 μl膜连蛋白-异硫氢酸荧光素,轻摇使其充分混匀。20 ℃铝箔纸遮光孵育15 min。800 g离心约5 min,弃上清,加入180 μl膜连蛋白-异硫氢酸荧光素结合液,轻摇使细胞重新悬浮。加入2 μl PI染色液轻摇混匀,冰浴后箔纸遮光放置。预备好待测样品后尽快(1 h)进行流式细胞仪检测。
使用SPSS 17.0软件进行统计分析,组间均数差异的比较采用ANOVA分析(单因素方差分析)或者Student-t检验的方法,方差齐时两两比较采用SNK检验,方差不齐时采用Dunnett′C检验,以P<0.05为差异有统计学意义。
PGCsi3.0含有绿色荧光蛋白(GFP)编码基因,有助于检测细胞转染的效率。利用Lipo 2000将PGCsi3.0-LSD1-siRNA转染结肠癌SW620细胞,48 h后于倒置荧光显微镜下观测,转染效率在80%以上(图1),适于进行后续的RNAi干扰实验。


A:一般光源下的SW620细胞;B:荧光源下的SW620细胞
转染LSD1-siRNA质粒对结肠癌SW620细胞中LSD1 mRNA及蛋白表达的影响:实验组与NC-siRNA组、空白组中LSD1 mRNA和LSD1蛋白的差异有统计学意义(分别为F=8.61,P<0.05;F=27.69,P<0.05和F=491.20,P<0.05;F=782.3,P<0.05),实验组LSD1 mRNA及蛋白的表达水平明显低于NC-siRNA组和空白对照组(图2,图3)。实验组中以siRNA-705组的LSD1 mRNA及蛋白的表达水平最低(分别为F=22.00,P<0.05和F=115.7,P<0.05),而NC-siRNA组和空白对照组之间差异无统计学意义(t=-0.139,P>0.05;t=0.12,P>0.05)。以上实验提示siRNA-705对LSD1基因的沉默效率最高,故采用siRNA-705进行后续实验。


1:空白对照组;2:NC-siRNA;3:siLSD#1;4:siLSD#2;5:siLSD#3


1:空白对照组;2:NC-siRNA;3:siLSD#1;4:siLSD#2;5:siLSD#3
不同浓度的Pargyline干预前(0 h),各组SW620细胞的增殖活性差异无统计学意义(F=0.52, P>0.05)。在24、48、72 h 3个时间节点,各组SW620细胞的增殖活性差异有统计学意义(依次F=24.71, P<0.05;F=74.86, P<0.05;F=174.39, P<0.05)。2.5、5.0和10.0 mmol/L浓度的Pargyline对SW620细胞生长的抑制效果明显高于0.5、1.0 mmol/L浓度组和对照组(P<0.05),而2.5、5.0和10.0 mmol/L浓度的Pargyline之间,以及0.5、1.0 mmol/L浓度的Pargyline和对照组之间SW620细胞的增殖活性差异无统计学意义(P>0.05)。因此,我们选择2.5 mmol/L的Pargyline进行后续实验(图4)。


LSD1-siRNA、Pargyline能使SW620细胞的增殖能力明显下降,且对细胞增殖的抑制作用呈时间依赖性。在24、48、72 h 3个时间节点,与对照组相比,siRNA组和Pargyline组中SW620细胞的增殖活性都明显降低(依次F=166.68, P<0.05;F=137.76, P<0.05;F=294.80, P<0.05)。但在24、48、72 h 3个时间节点,siRNA组与Pargyline组的细胞增殖活性差异无统计学意义(P>0.05),空载体组与阴性对照组的细胞增殖活性差异亦无统计学意义(P>0.05)(图5)。


siRNA组和Pargyline组的SW620细胞侵袭性明显低于空载体组和阴性对照组(F=100.41, P<0.05),siRNA组和Pargyline组的SW620细胞侵袭性差异无统计学意义(t=-0.232, P>0.05),空载体组和阴性对照组细胞侵袭性差异无统计学意义(t=0.702, P>0.05)(图6)。


A:对照组;B:siRNA组;C:Pargyline组;D:空载体组
siRNA组和Pargyline组SW620细胞的凋亡率明显高于空载体组和阴性对照组(F=260.23, P<0.05),而siRNA组和Pargyline组的SW620细胞凋亡率差异无统计学意义(t=2.68, P>0.05),空载体组和阴性对照组细胞凋亡率差异无统计学意义(t=-0.10, P>0.05)(图7)。


A:对照组;B:siRNA组;C:Pargyline组;D:空载体组
LSD1-siRNA、Pargyline对SW620细胞中LSD1、E-cadherin、N-cadherin mRNA、蛋白表达的影响:(1)siRNA组和Pargyline组的LSD1、N-cadherin的蛋白水平较空载体组和阴性对照组明显下调(分别F=618.98, P<0.05;F=114.60, P<0.05),E-cadherin的蛋白水平较空载体组和阴性对照组明显上调(F=800.81, P<0.05)(图8)。(2) siRNA组和Pargyline组的LSD1、N-cadherin mRNA水平较空载体组和阴性对照组明显下调(分别F=173.85, P<0.05;F=209.69, P<0.05),E-cadherin mRNA水平较空载体组和阴性对照组明显上调(F=245.85, P<0.05)。


1:对照组;2:siRNA;3:Pargyline;4:空载体组
组蛋白(histones)是真核细胞染色质中的主要蛋白组分。组蛋白修饰通过改变组蛋白与DNA之间的动力学关系而影响染色质构象,从而激活或阻断基因的转录与翻译,在肿瘤的发生、增殖、侵袭转移中发挥重要作用。组蛋白修饰可作为一种标志或语言,有人提出了"组蛋白密码"的假说[5],组蛋白修饰已经成为表观遗传学的重要组成部分。
我们在前期研究中发现LSD1的表达在组织和细胞水平与结肠的侵袭转移能力呈正相关,阳性表达LSD1、阴性表达E钙黏蛋白的结肠癌患者往往预示着更差的预后[6]。在本部分实验中,我们发现抑制LSD1的表达能在体外有效抑制结肠癌细胞的增殖、转移,诱导结肠癌细胞凋亡。
无序增殖是恶性肿瘤的重要生物学特征。已经在多种恶性肿瘤中证实,LSD1可以促进肿瘤细胞的无序增殖,并可成为评估预后的分子生物标记,高表达往往预示着更低的5年总体生存率。LSD1对于维持细胞的增殖必不可少,LSD1能促进细胞周期时相的转变,从而促进肿瘤细胞的增殖[7]。并非所有细胞的增殖都受到LSD1的调控,LSD1仅对具有多向分化潜能的肿瘤细胞促进增殖的作用明显,而对不具有多向潜能的正常体细胞的作用效果微弱[8]。
与其他上皮源性的恶性肿瘤一样,结肠癌的转移也与上皮间质转化有关。包括Snail、Slug等在内的锌指蛋白家族在上皮间质转化过程中发挥重要作用,其能通过"钙黏蛋白转换(Cadherin switching)"使肿瘤细胞更富于侵袭转移性[9,10,11],通过"侵袭-转移级联反应"形成远处转移灶。Snail能直接抑制E-cadherin的表达而促进EMT的发生,促进肿瘤转移,但EMT过程中的潜在表观遗传调节机制尚不清楚。研究显示[2,12],Snail与LSD1-CoREST复合物结合并将LSD1招募至E-cadherin基因的启动子区域,使该区域二甲基化的组蛋白3第4位赖氨酸(H3K4m2)去甲基化,从而抑制E-cadherin的表达。在缺乏LSD1的情况下,E-cadherin启动子区域的H3K4m2水平明显增高,Snail对E-cadherin的抑制将部分被逆转,甚至失去抑制作用。这提示在EMT过程中,LSD1的存在对于Snail介导的基因转录抑制是必不可少的,LSD1有望成为阻止肿瘤转移的治疗靶点。
但Snail是如何与LSD1-CoREST复合物相互作用的,与E-cadherin启动子区域结合的是Snail还是LSD1-CoREST复合物?Lin等[2]的研究显示,Snail的SNAG结构域和LSD1的胺氧化酶结构域对二者的相互作用必不可少。Lin等推测SNAG结构域类似于组蛋白H3样的结构,能扮演"分子挂钩"的角色与LSD1-CoREST复合物相互作用,形成Snail1-LSD1-CoREST三元络合物,该络合物对上述蛋白的功能和稳定性非常重要,避免被酶降解。Snail通过其锌指结构将该络合物与靶基因启动子的E-box序列结合,抑制靶基因的表达。
我们的研究发现:在LSD1-siRNA和Pargyline(抑制LSD1的酶活性)干预SW620细胞72 h后,SW620细胞的内LSD1、N-cadherin的表达水平明显下调,而E-cadherin的水平明显上调,细胞的侵袭性降低。我们推测:LSD1能通过其组蛋白特异性去甲基化酶的活性,下调E-cadherin启动子区域组蛋白H3K4的甲基化水平,利用表观遗传修饰途径调节靶基因的转录和翻译,最终影响结肠癌侵袭和转移。因此,我们拟更加深入地开展LSD1影响结肠癌转移机制的研究。
综上所述,LSD1-siRNA和单胺氧化酶抑制剂Pargyline能在体外有效抑制LSD1的表达,并能抑制结肠癌细胞的增殖、侵袭转移,诱导细胞凋亡。LSD1可能通过下调E钙黏蛋白启动子区域H3K4m2水平的途径抑制E钙黏蛋白的转录,并有可能成为阻止结肠癌转移的新的分子靶点,这些都有待于体外细胞实验和动物实验的进一步证实。










