临床研究
广东地区汉族产前人群δ地贫基因的突变谱与血液学分析
中华医学杂志, 2017,97(20) : 1580-1583. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2017.20.016
摘要
目的

研究中国广东地区汉族产前人群中δ地贫球蛋白基因(HBD)的突变类型以及各类型突变频率,并统计分析各类型突变的血液学变化,以丰富人群δ-地贫基因突变图谱。

方法

收集2012年1月至2015年5月在我院进行产前地中海贫血筛查的样本7 580例,筛选出符合条件的33例患者,男10例,女23例,年龄22~48岁。用XE 4000i血细胞分析仪进行血细胞分析,高效液相色谱法(HPLC)进行血红蛋白(Hb)、血红蛋白A2(HbA2)和血红蛋白F(HbF)定量检测。提取基因组DNA后进行PCR扩增、基因测序方法检测目标样本基因突变。

结果

33例患者中检出21例存在δ-地贫突变,突变率约为0.277%(21/7 580)。检测出7种不同的突变类型。其中4种为已知的突变类型,包括12例基因型为-77(T>C)[HBD c.-127 (T>C)](57.14%),4例为-30 (T>C)[HBD c.-80 (T>C)](19.05%),1例为codon 10 (-G) (HBD c.31delG)(4.76%),1例为HBD c.244 C>T;另外新发现3种突变,1例为HBD c.22_24delGAG(4.76%),1例为HBD c.347 C>T(4.76%),1例为HBD c.349 C>G(4.76%)。

结论

δ地贫基因突变类型多样,-77(T>C)是广东地区汉族产前人群最常见的δ球蛋白基因突变。本研究报道的3例新突变丰富了δ球蛋白基因的突变谱,应重视产前人群的δ球蛋白基因检测,对产前咨询和诊断有重要意义。

引用本文: 钟良英, 谢英俊, 陈培松, 等.  广东地区汉族产前人群δ地贫基因的突变谱与血液学分析 [J] . 中华医学杂志, 2017, 97(20) : 1580-1583. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2017.20.016.
参考文献导出:   Endnote    NoteExpress    RefWorks    NoteFirst    医学文献王
扫  描  看  全  文

正文
作者信息
基金 0  关键词  0
English Abstract
评论
阅读 0  评论  0
相关资源
引用 | 论文 | 视频

版权归中华医学会所有。

未经授权,不得转载、摘编本刊文章,不得使用本刊的版式设计。

除非特别声明,本刊刊出的所有文章不代表中华医学会和本刊编委会的观点。

地中海贫血是一种常染色体隐性遗传疾病。正常成人血红蛋白由血红蛋白A0(HbA0,α2β2,占比>96%)和血红蛋白A2(HbA2,α2δ2,占比2.5%~3.5%)及血红蛋白F(HbF,α2γ2,占比<1%)组成。发生在δ球蛋白基因(HBD)的突变或结构变异,将导致δ球蛋白合成减少,有的还伴随HbA2变异体[1]。通常β地中海贫血的患者由于β链合成减少而造成δ链合成相对增加,因此典型β地中海贫血的患者HbA2>3.5%。尽管δ蛋白基因的突变没有明显的临床表现[2,3],但当合并β地中海贫血时,由于δ链合成减少,使HbA2维持在正常水平甚至降低而掩盖了β地贫的存在,导致β地贫的漏诊[4,5]。华南地区人群β地中海贫血的突变携带率为2.54%[6],因此,检测HBD基因的突变是有必要的,尤其在产前人群中,夫妻一方有β地贫存在时。本研究通过对δ地中海贫血患者进行HBD基因检测,研究广东地区汉族产前人群中δ地贫的基因突变类型。

对象与方法
1.对象:

回顾性分析2012年1月至2015年5月在中山大学附属第一医院进行产前地中海贫血筛查的患者资料,从中选取符合以下条件的样本[7,8]:(1)血液样本高效液相色谱(HPLC)电泳结果HbA2<2.5%,伴或不伴有HbA2变异体的存在,或β地贫的HbA2低于预期;(2)HbA2<2.5%,且平均红细胞体积(MCV)≥27 fl和(或)平均红细胞血红蛋白量(MCH)≥81 pg;(3)排除缺铁性贫血或α地贫。所选样本入选标准为:(1)+(3)或(2)+(3)。共收集到符合条件患者33例,男10例,女23例,年龄22~48岁,均为广东地区汉族人群。所有受检对象采用乙二胺四乙酸二钾(EDTA-K2)真空抗凝管抽取静脉血2 ml。

2.仪器与试剂:

血细胞分析仪(XE 4000i,日本Sysmex公司),高效液相色谱电泳仪(Variant Ⅱ,美国Bio-Rad公司),离心机(Eppendorf 5240,德国Eppendorf公司),全血基因组DNA提取试剂盒(Quickgene , Fujifilm,日本Kurabo公司),PCR扩增仪(ABI9700,美国ABI公司),凝胶成像分析系统(Vilber Louramt FUSION FX7,法国VILBER公司),水平电泳槽及电泳仪(美国Bio-rad公司)及恒温杂交仪(YN-H16,深圳亚能生物公司)。

3.血液学分析指标:

红细胞血红蛋白量(Hb)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)。

4.HPLC检测:

高效液相色谱电泳仪检测HbA0、HbA2、HbF水平。正常值:HbA0≥80%;HbA2:2.5%~3.5%;HbF: 0~3.5%。抽取外周静脉血2 ml进行血红蛋白电泳。收集HbA2<2.5%的样本。

5.基因分析:

δ地贫HBD基因检测的引物序列和PCR扩增参考文献[7]。

6.DNA测序及结果分析:

待测样品的PCR扩增产物电泳检测呈现单一清晰明亮条带,与标准带对照鉴定扩增产物片段大小和浓度是否符合测序要求,即可将待测样品直接送华大基因公司完成测序。目的片段序列通过chromas及clustal X软件与参考序列进行比对,找到突变位点后,进一步对异常结果做反向测序以验证结果的可靠性。

结果
1.δ地贫阳性检出率:

33份样本中,21份有δ地贫基因缺陷,阳性检出率为63.64%。

2.δ地贫基因突变率:

在来我院进行产前筛查的7 580例患者中,筛选出符合条件的患者33例,其中发现21例有δ地贫基因缺陷,δ地贫基因突变率约为0.277%(21/7 580)。

3.δ地贫基因突变谱:

发现了7种缺陷类型,其中4种为已知的缺陷类型,3种为新发现的缺陷类型。最常见的突变类型为-77 (T>C),共12份样本检测出该类型,占57.15%(12/21);其次是-30 (T>C),占19.05%(4/21)。结果见表1

点击查看表格
表1

南方汉族产前人群的δ球蛋白基因突变谱

表1

南方汉族产前人群的δ球蛋白基因突变谱

基因型例数频率(%)HbA2(%)位点
-77 (T>C)1257.151.6±0.2c.-127T>C
-30 (T>C)419.051.3±0.4c.-80 T>C
codon 10 (-G)14.761.6c.31delG
HbA2 Saint-Denis14.760.5c.244 C>T
codon8(p.Glu8del)14.761.9c.22_24delGAG
codon115(GCC>GTC)14.761.9c.347C>T
codon116(CGC>GGC)14.761.2c.349C>G

注:HbA2:血红蛋白A2

4.基因测序结果:

δ球蛋白基因测序结果见图1图2

点击查看大图
图1
δ球蛋白基因测序结果A、B、C、D图分别为4种已知突变的测序图,箭头所示为突变位点
点击查看大图
图1
δ球蛋白基因测序结果A、B、C、D图分别为4种已知突变的测序图,箭头所示为突变位点
点击查看大图
图2
δ球蛋白基因测序结果A、B、C图分别为3种新发现突变的测序图,A、C 图箭头所示为突变位点,B图示缺失GAG碱基
点击查看大图
图2
δ球蛋白基因测序结果A、B、C图分别为3种新发现突变的测序图,A、C 图箭头所示为突变位点,B图示缺失GAG碱基
5.基因型和血液学分析:

21例δ地中海贫血患者的基因型和血液学分析结果见表2

点击查看表格
表2

21例δ地中海贫血患者的基因型和血液学分析

表2

21例δ地中海贫血患者的基因型和血液学分析

例序性别年龄(岁)基因型HbA2(%)HbF(%)Hb(g/L)MCH(pg)MCV(fl)
135-77 (T>C)1.60.68730.693.0
228-77 (T>C)1.62.114329.183.1
326-77 (T>C)1.20.812129.589.3
427-77 (T>C)1.71.215729.384.7
536-77 (T>C)1.70.714730.690.4
627-77 (T>C)1.60.613729.584.9
725-77 (T>C)1.52.312929.690.1
827-77 (T>C)1.84.311931.589.4
935-77 (T>C)1.50.911625.676.9
1048-77 (T>C)2.15.55834.3105.9
1127-77 (T>C)1.52.210929.492.5
1229-77 (T>C)1.41.612727.783.0
1326-30 (T>C)1.90.710932.293.5
1429-30 (T>C)0.80.315930.687.7
1528-30 (T>C)1.60.211924.480.1
1633-30 (T>C)0.90.712131.589.3
1730HbA2 Saint-Denis0.50.612329.488.0
1826codon10(-G)1.60.214928.784.8
1930codon116(CGC>GGC)1.50.216630.285.2
2037codon 115(GCC>GTC)1.90.316031.490.6
2125condon8(delGAG)1.90.411930.790.7

注:HbA2:血红蛋白A2;HbF:血红蛋白F;Hb:血红蛋白;MCH:平均红细胞血红蛋白含量;MCV:平均红细胞体积

讨论

在成人阶段,δ珠蛋白的表达量约为β球蛋白的1/50,其与δ珠蛋白链构成HbA2。当出现δ珠蛋白基因突变或缺失时,δ珠蛋白链合成的质量或者数量下降,导致HbA2下降或者出现HbA2变异体。由于δ珠蛋白占人体总珠蛋白很少,所以δ地中海贫血没有明显临床表现。

迄今为止,有117种突变导致δ结构变异或导致δ地贫[9]。对于不同种群,δ地贫的基因缺陷类型以及各类型的发病率均有差异。Pavlou等[10]对希腊塞浦路斯人群δ地贫突变的研究统计出11种有义突变,其中最普遍的是HbA2-Yialousa,占所有缺陷类型的60.7%,其次是codon4C→T,占17.8%。Giambona等[8]对西西里人群δ地贫做了大量的研究,统计出12种缺陷类型,其中最普遍的也是HbA2-Yialousa,占81%,而且HbA2-Yialousa、HbA2 -NYU和IVS II nt 897 A→G共3种缺陷类型加起来占总缺陷的90%以上。Morgado等[11]对葡萄牙人群的研究发现6种δ球蛋白基因缺陷类型,其中HbA2-Yialousa也是最普遍的。对广东地区汉族产前人群的δ地贫研究显示,-77(T>C)[HBD -127(T>C)]突变是最常见的,这和其他国家和地区有显著差异,但与Liu等[7]和Xiong等[12]的结果一致。本研究中有12份样本携带此突变,占57.14%,这些样本的HbA2为(1.6±0.2)%。该突变位于δ球蛋白基因高度保守的核心序列区(GATA-1 motif),通过影响与GATA-1位点的结合使球蛋白基因表达下降[13]。其次是-30 (T>C)[HBD c.-80 (T>C)],占21例δ球蛋白基因缺陷的19.05%(4/21)。其HbA2为(1.3±0.4)%。该突变与δ球蛋白基因TATA盒有关,导致δ球蛋白基因转录减少,引起δ地中海贫血[14]。本研究发现1份样本为codon10(-G)(HBD c.31delG),其HbA2为1.2%,该移码突变使δ球蛋白在合成第94个氨基酸后合成提前终止,导致δ0地中海贫血。有1份样本为HbA2 Saint-Denis[delta 81(EF5) Leu>Phe,HBD c.244C>T][15],其HbA2为1.6%。

此外,本研究新发现了3种突变。其中1例为codon116(CGC>GGC)[δ116(G18)Arg(R) >Gly(G)](HBD c.349C>G),导致第116位密码子CGC转变为GGC,致使精氨酸转变为甘氨酸,该患者为男性,其HbA2为1.5%。1例为codon 115(GCC>GTC)[δ116(G17)Ala(A)>Val(V)],导致第115位密码子GCC转变为GTC,致使丙氨酸转变为缬氨酸,其HbA2为1.9%。1例为codon8(p.Glu8del)(HBD c.22_24delGAG),导致第八位密码子编码的谷氨酸丢失,其HbA2为1.9%。

本研究δ球蛋白基因缺陷阳性检出率为56.7%。其余12份样本,其HbA2<2.5%,且MCV、MCH正常,并除外缺铁性贫血和α地贫,但并未发现有δ球蛋白基因缺陷,这可能与引物设计有关,也可能是HPLC测量的HbA2不准确,或者δ球蛋白基因较大片段缺失,而测序未能测清。

通过对广东地区汉族产前人群中δ球蛋白基因的研究,发现其突变率约为0.277%,比Liu等[7]报道的0.4%略低,这可能与本研究样本量不够大和入选标准有关。这也意味着δ球蛋白基因缺陷在中国人群中是很罕见的。因此,对于HbA2水平降低但MCV正常的人群目前还不需要进行常规的δ球蛋白基因筛查。但对于那些MCV、MCH降低而HbA2水平正常或降低的患者在排除缺铁性贫血或者是δ地贫后,一方有此性状的夫妇,尤其另一方已经确诊为β地贫,需对患者做进一步的δ和β地贫基因分析,这样可以预防重型β地贫患儿的出生。

参考文献
[1]
MoscaA, PaleariR, IvaldiG, et al. The role of haemoglobin A2 testing in the diagnosis of thalassaemias and related haemoglobinopathies[J].J Clin Pathol200962(1):13-17.DOI: 10.1136/jcp.2008.056945.
[2]
De AngiolettiM, LacerraG, GaudianoC, et al. Epidemiology of the delta globin alleles in southern Italy shows complex molecular, genetic, and phenotypic features[J].Hum Mutat, 2002, 20(5): 358-367.DOI: 10.1002/humu.10132.
[3]
LacerraG, ScaranoC, LagonaLF, et al. Genotype-phenotype relationship of the δ-thalassemia and Hb A(2) variants: observation of 52 genotypes[J]. Hemoglobin, 2010, 34(5):407-423.DOI: 10.3109/03630269.2010.511586.
[4]
CodringtonJF, LiH-W, KutlarF, et al. Observations on the levels of Hb A2 in patients with different beta-thalassemia mutations and a delta chain variant[J].Blood, 1990, 76(6): 1246-1249.
[5]
LacerraG, MusollinoG, ScaranoC, et al. Molecular evidences of single mutational events followed by recurrent crossing-overs in the common delta-globin alleles in the Mediterranean area[J]. Gene, 2008, 410(1):129-138.DOI: 10.1016/j.gene.2007.12.004.
[6]
XuXM, ZhouYQ, LuoGX, et al. The prevalence and spectrum of alpha and beta thalassaemia in Guangdong Province: implications for the future health burden and population screening[J]. J Clin Pathol, 2004, 57(5):517-522.DOI: 10.1136/jcp.2003.014456.
[7]
LiuN, XieXM, ZhouJY, et al. Analysis of δ-globin gene mutations in the Chinese population[J]. Hemoglobin, 2013, 37(1): 85-93. DOI:10.3109/03630269.2012.747965.
[8]
GiambonaA, PassarelloC, G RuggeriG, et al. Analysis of delta-globin gene alleles in the Sicilian population: identification of five new mutations[J]. Haematologica, 2006, 91(12): 1681-1684.
[9]
GiardineB, BorgJ, ViennasE, et al. Updates of the HbVar database of human hemoglobin variants and thalassemia mutations[J]. Nucleic Acids Res201442(Database issue):D1063-1069. DOI: 10.1093/nar/gkt911.
[10]
PavlouE, PhylactidesM, KyrriA, et al. δ-Thalassemia in Cyprus[J]. Hemoglobin, 2006, 30(4):455-462.DOI: 10.1080/03630260600868006.
[11]
MorgadoA, PicançoI, GomesS, et al. Mutational spectrum of delta-globin gene in the Portuguese population[J]. Eur J Haematol, 2007, 79(5):422-428.DOI: 10.1111/j.1600-0609.2007.00949.x.
[12]
XiongF, SunM, ZhangX, et al. Molecular epidemiological survey of haemoglobinopathies in the Guangxi Zhuang Autonomous Region of southern China[J]. Clin Genet, 2010, 78(2):139-148.DOI: 10.1111/j.1399-0004.2010.01430.x.
[13]
MatsudaM, SakamotoN, FukumakiY. δ-Thalassemia caused by disruption of the site for an erythroid-specific transcription factor, GATA-1, in the δ-globin gene promoter[J]. Blood, 1992, 80(5):1347-1351.
[14]
HuangCH, KoTM, ChiangYL, et al. Mutation at 30 (T→C) of the δ-globin gene in a Taiwanese β-thalassemia carrier[J]. Hemoglobin, 2003, 27(3):205-209.DOI: 10.1080/03630260600868006.
[15]
KhalilMS, MaroufS, ElementD, et al. A study of δ-globin gene mutations in the UK population: identification of three novel variants anddevelopment of a novel DNA test for Hb A′2[J]. Hemogobin, 2014, 38(3):201-206.DOI: 10.3109/03630269.2014.885908.
 
 
展开/关闭提纲
查看图表详情
回到顶部
放大字体
缩小字体
标签
关键词