病例对照研究是最经典的流行病学研究类型之一。近年来，在其基础上衍生出了几种新的研究方法，避免了传统病例对照研究的一些局限性，扩大了研究适用范围，成为临床研究方法学进展的重要组成部分。现将这几种新的研究方法做简要介绍。

是一种常用于病因学研究中评价基因和环境交互作用的研究方法。与病例对照研究相比，其最大特点是研究对象仅为特定疾病的一组患者群体而不用对照，其基本原理是将确诊的患有目标疾病的患者作为研究对象，收集患者的人口学资料、环境暴露因素、潜在混杂因素和生物标本，通过分子生物学检测后，根据某一基因型的有无将研究对象分为类病例组和类对照组，进行统计分析，判断有无相乘模型的交互作用。该研究方法的应用有2个前提条件：（1）研究疾病为罕见病，一般认为疾病患病率小于5%；（2）目标基因型与环境暴露因素需要各自独立发生，表示为携带某基因型不会影响环境暴露的概率或环境暴露不会改变基因型。单纯病例研究设计的最主要优势是避免了由于未患病人群的选择而导致的选择偏倚。另外，在估计交互作用时精确度更高，即同样检验效能等条件下，所需样本量比病例对照研究样本量少。

是一种用于调查短暂暴露与特定急性事件关联的流行病学方法，广泛应用于药物不良反应、心脑血管疾病和伤害等方面的研究。病例交叉设计只需要收集病例组的人口学信息和过往暴露信息，比较相同研究对象在急性事件发生前一段时间的暴露情况和未发生时的某段时间内的暴露情况，从而估计研究的短暂暴露与结局的关联强度。事件发生前的一段时间称为效应期或危险期。与病例对照研究相比，病例交叉设计的病例是以自身为对照，有效控制了已知和未知的混杂因素对于关联强度的影响。研究对象通常对于急性事件发生前一段时间是否接触过某种待研究的物质或行为的记忆较为清晰，很大程度上避免了回忆偏倚。

是从病例交叉设计衍生出的一种研究方法，将研究范围从短期暴露扩展到探索慢性暴露与结局关联的研究。在真实环境下，药物的使用会发生"自然变化"，例如患者对药物依赖性增强，市场对药物的宣传力度增加等，这类"自然变化"形成的指示性混杂效应会影响待研究的暴露与结局的关联强度。病例时间对照设计的原理是在病例交叉设计的基础上另设一对照组，对组内每个研究对象进行2次测量，测量的时间段与病例组相同，分析获得药物使用随时间推移而产生的"自然变化"效应。将病例交叉分析所得效应减去药物"自然变化"效应后即为暴露对事件发生的净效应。