肠道病毒（EV）是人类最常见的病原体，常引发大规模的疾病，如：手足口病、疱疹性咽峡炎、心肌炎、脑炎、无菌性脑膜炎、急性弛缓性麻痹及急性弛缓性脊髓炎等神经系统和心肺疾病，且多感染5岁以下儿童，严重时可引起致命的并发症。近年来，非肠道病毒71型（EV71）和非柯萨奇病毒A组16型（CV-A16）肠道病毒流行强度逐渐增强，EV优势流行株逐渐发生了变化，及时掌握EV的病原学、流行病学、分子进化特征，对于EV的防控具有重要的意义。因此，本文对非EV71和非CV-A16肠道病毒所致疾病现状及分子流行病学进行阐述，以期对EV的防控产生一定的提示作用。
肠道病毒（enteroviruses，EV）早在20 世纪50年代就被人们所发现，是目前研究较为详细的病毒。EV感染呼吸道和胃肠道黏膜，主要通过粪-口途径传播。目前，已发现超过100种型别的肠道病毒能够感染人类［1］，并导致大量的发病率。EV属于微小核糖核酸病毒科肠道病毒属，是单股正链RNA病毒，它的编码区由一个长7.2~8.5 kb的开放阅读框（open-reading frame，ORF）组成，编码一个约2 185个氨基酸的多聚蛋白，在感染期间，细胞和宿主蛋白酶会将这个多聚蛋白分解成4个结构蛋白（VP1、VP2、VP3及VP4）和7个非结构蛋白（2A、2B、2C、3A、3B、3C及3D）。3D基因编码的RNA依赖型RNA聚合酶会在每个基因组复制事件中错误合并一个或两个碱基，校对性内切酶活性的缺失会导致复制出错的概率增加，从而导致EV基因组之间的高遗传变异性［2］。国际病毒分类委员会（International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）根据编码基因区域的序列、受体和宿主范围、基因组组织及成分将EV分为15个基因型（表1），即肠道病毒A~L、鼻病毒A~C［3, 4, 5］，包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒、埃可病毒和新型肠道病毒等，其中感染人类的EV主要属于肠道病毒A~D型［6］。EV常引起神经系统的疾病，严重可致死亡，自EV被首次分离以来，肠道病毒71型（enterovirus 71，EV71）和柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16，CV-A16）感染成为全球的重大公共卫生问题。但近年来，肠道病毒的流行趋势逐渐发生了变化，其他肠道病毒（即非EV71和非CV-A16病毒）引起的感染日益凸显，如：肠道病毒柯萨奇病毒A组6型（coxsackievirus A 6，CV-A6）、柯萨奇病毒A组10型（coxsackievirus A 10，CV-A10）、柯萨奇病毒B组1型（coxsackievirus B1，CV-B1）、柯萨奇病毒B组3型（coxsackievirus B3，CV-B3）、柯萨奇病毒B组5型（coxsackievirus B5，CV-B5）、埃可病毒25型（Echovirus 25，Echo25）及埃可病毒30型（Echovirus 30，Echo30）等［7, 8, 9, 10, 11, 12, 13］。尤其在2016年我国自主研制的全球首支EV71灭活疫苗获批上市后，EV71引起的病例和死亡率明显降低。本文主要对非EV71和非CV-A16肠道病毒的流行病学现状、病原变化及分子流行病学进行分析，为有效防控肠道病毒感染提供依据。
