技术方法
戊型肝炎病毒3种核酸检测方法的比较
中华实验和临床病毒学杂志, 2020,34(1) : 67-71. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2020.01.014
摘要
目的

比较戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)3种核酸检测方法的敏感性及特异性。

方法

将HEV基因4型代表株的开放阅读框(open reading frame,ORF)2区部分基因序列克隆至pUC57载体,合成质粒DNA,使用A、B两种实时定量方法检测该质粒,比较最低检出限;使用其他标本做特异性检测。使用3种方法平行检测急性戊肝病例血清标本,比较检测结果。

结果

A、B方法对质粒DNA的最低检出限均可达35拷贝数/反应,特异度均为100%;A、B和C方法对急性戊肝病例血清标本HEV RNA检出阳性率分别为47.8%(43/90)、43.3%(39/90)和41.1%(37/90),一致率为88.9%(80/90),3种方法的检出率之间无统计学差异(χ2=0.8414,P=0.6566)。A方法检测Ct值≤34.6或者B方法检测Ct值≤35.6的血清标本,C方法扩增成功率为100%。

结论

A方法的敏感性和特异性均较高,C方法为灵敏的基因检测方法。

引用本文: 尹文娇, 邱丰, 周文亭, 等.  戊型肝炎病毒3种核酸检测方法的比较 [J] . 中华实验和临床病毒学杂志, 2020, 34(1) : 67-71. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2020.01.014.
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人戊型肝炎(戊肝)是由戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)感染引起的一种以侵犯肝脏为主的传染性疾病。HEV是一种小的、无包膜、单股正链RNA病毒[1],主要感染人类的HEV目前被划归为戊肝病毒科、正戊肝病毒属[2]、A种。HEV基因组全长7.2~7.6Kb,有至少3个开放读码框(open reading frame, ORF),其中ORF2位于3’端,长约2Kb,编码核衣壳蛋白。根据ORF2区的核苷酸序列差异,HEV已被划分为8个基因型别(gt1-8)[3,4,5,6,7,8]。HEV核酸检测,是急性戊肝诊断的重要手段之一。HEV基因分型是戊肝溯源的重要手段,对散发或暴发疫情调查具有重要意义。常采用逆转录PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)方法进行基因分型。本研究的目的是比较国际上应用较广泛的两种实时定量PCR方法(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)与国内一种RT-PCR基因分型方法的检测性能。

 
 
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