综述
基于CRISPR系统的新型冠状病毒核酸诊断方法研究进展
中华实验和临床病毒学杂志, 2023,37(2) : 227-236. DOI: 10.3760/cma.j.cn112866-20220719-00162
摘要

由新型冠状病毒所引起的新型冠状病毒肺炎疫情仍在持续,随着疫情的持续,新型冠状病毒基因组也在不断地发生变异和进化,产生了越来越多的新冠病毒变异株,给新冠疫情的防控带来了严重压力。针对新冠疫情的传播,通过核酸检测的方法来明确新型冠状病毒的感染,以及鉴别新型冠状病毒变异株极其重要,因此迫切需要开发现场化、高通量、自动化等不同应用场景的高灵敏、高特异检测方法来实现对新型冠状病毒及其变异株的诊断。目前,研究人员利用基于成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)的核酸检测技术与侧向流层析试纸等多种技术相结合建立了多种针对的新型冠状病毒以及新冠变异株的诊断方法,以应用于不同的场景及地区。本文对基于CRISPR的新型冠状病毒诊断方法研究进展进行了总结。

引用本文: 牛梦伟, 李浩, 肖瑞, 等.  基于CRISPR系统的新型冠状病毒核酸诊断方法研究进展 [J] . 中华实验和临床病毒学杂志, 2023, 37(2) : 227-236. DOI: 10.3760/cma.j.cn112866-20220719-00162.
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1 新型冠状病毒及其变异概述

新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2;SARS-CoV-2)是一种单股正链RNA病毒,其基因组全长约32 KB,具有多个开放读框(open reading framework, ORF),除编码16个非结构蛋白(non-structural protein, Nsp)外,还可编码包膜(envelope, E)蛋白、刺突(spike, S)蛋白、核衣壳(nucleocapsid, N)蛋白、膜(membrane, M)蛋白等结构蛋白[1,2]。SARS-CoV-2基因组序列由N蛋白组成的螺旋衣壳覆盖,并被E蛋白包裹,组成SARS-CoV-2主体结构体,E蛋白与M蛋白主要参与病毒在宿主细胞中的病毒组装,S蛋白则主要参与病毒入侵宿主细胞的过程。

 
 
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