论著
腿伤凯斯特菌生物学特性及质谱自建库的建立
中华检验医学杂志, 2023,46(2) : 197-202. DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20221219-00742
摘要
目的

了解腿伤凯斯特菌的生物学特点,并采用基质辅助激光解吸飞行时间质谱的方法进行自建库,为腿伤凯斯特菌在质谱仪上快速、准确地鉴定提供支持。

方法

收集2020年11月至2022年2月从南部战区总医院临床患者标本中分离的38株腿伤凯斯特菌,利用全自动微生物分析系统(Vitek-2 Compact)、全自动微生物质谱检测系统(Vitek-MS)以及16S核糖体RNA(16S rRNA)测序的方法鉴定菌种;选取13株菌,使用Vitek-MS获取质谱图谱,应用SARAMIS软件构建腿伤凯斯特菌图谱库,并用剩余25株菌验证构建的自建库。

结果

Vitek-2 Compact、Vitek-MS均未能鉴定出腿伤凯斯特菌;选取13株菌成功通过SARAMIS软件构建腿伤凯斯特菌的自建库,25株验证菌株均被鉴定为腿伤凯斯特菌,可信度>99.0%,准确率100%(25/25)。

结论

腿伤凯斯特菌有独特的质谱图谱,可通过图谱自建库的建立快速、准确鉴定到种。

引用本文: 吴伊雪, 孙朝晖, 黄晓燕, 等.  腿伤凯斯特菌生物学特性及质谱自建库的建立 [J] . 中华检验医学杂志, 2023, 46(2) : 197-202. DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20221219-00742.
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腿伤凯斯特菌最初被称为类粪产碱菌,由于大部分菌株分离自腿部伤口,直到2003年才正式命名为腿伤凯斯特菌1。在分类学上,凯斯特菌属与鲍特菌属、无色杆菌属、颇陌菌属、类产碱杆菌属和产碱杆菌属共同隶属于产碱菌科、β变形杆菌纲、伯克霍尔德菌目,该菌属包括腿伤凯斯特菌和模仿凯斯特菌两个种2。近年来,有更多的学者开始注意该菌,但是相关研究仍较少。腿伤凯斯特菌在表型上与粪产碱菌相似,而全自动微生物鉴定药敏仪Vitek-2 Compact及Vitek-MS的IVD数据库(版本3.0)和RUO SARAMIS 数据库(版本4.16)均未能鉴定该菌,16S 核糖体RNA(16S rRNA)是目前能鉴定出该菌的方法,但不适用常规临床微生物实验室。因此建立腿伤凯斯特菌独有的蛋白指纹图谱有利于实验室利用Vitek-MS实现腿伤凯斯特菌的快速及准确鉴定。

 
 
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