论著
RAS和BRAF V600E基因突变与结直肠癌临床病理特征的相关性
肿瘤研究与临床, 2022,34(8) : 591-595. DOI: 10.3760/cma.j.cn115355-20220308-00131
摘要
目的

探讨结直肠癌患者KRAS、NRAS、BRAF V600E基因突变与临床病理特征的相关性。

方法

选取山西省肿瘤医院2020年1月至2021年12月手术切除并经病理证实为结直肠癌217例患者标本,回顾性分析患者临床资料。采用直接测序法检测手术切除组织的石蜡标本中KRAS、NRAS、BRAF V600E基因突变情况。比较不同临床病理特征患者的KRAS、NRAS、BRAF V600E突变率。

结果

217例结直肠癌患者中KRAS、NRAS、BRAF V600E基因突变率分别为48.4%(105/217)、4.1%(9/217)、3.7%(8/217),其中1例(0.5%)患者同时存在KRAS和NRAS突变。NRAS基因突变与性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤部位、病理类型、分化程度、浸润深度、淋巴结转移、远处转移、TNM分期、血管瘤栓/神经侵犯均无相关性(均P>0.05);年龄≥60岁患者KRAS基因突变率高于<60岁患者[55.3%(63/114)比40.8%(42/103),χ2=4.55,P=0.033],KRAS基因突变与其他临床病理特征均无相关性(均P>0.05);伴远处转移的患者BRAF V600E基因突变率高于无远处转移患者[16.7%(4/24)比2.1%(4/193),P=0.006],BRAF V600E基因突变与其他临床病理特征均无相关性(均P>0.05)。

结论

结直肠癌患者年龄大可能易发生KRAS基因突变,伴远处转移者BRAF V600E基因突变率较高,NRAS基因突变与临床病理特征无相关性。

引用本文: 薄云峰, 徐恩伟, 高宁, 等.  RAS和BRAF V600E基因突变与结直肠癌临床病理特征的相关性 [J] . 肿瘤研究与临床, 2022, 34(8) : 591-595. DOI: 10.3760/cma.j.cn115355-20220308-00131.
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结直肠癌是消化道常见的恶性肿瘤之一,据2018年全球癌症统计数据显示,结直肠癌的发病率和死亡率分别居全球第3位和第2位,已经成为严重威胁人类健康的疾病之一[1]。结直肠癌的发生、发展是一个多基因、多步骤调控的复杂过程,研究发现MAPK信号通路的异常激活在结直肠癌发生、发展过程中起着重要作用[2],位于MAPK信号转导通路上的RAS、BRAF基因已经成为结直肠癌靶向治疗的重要分子标志物[3],美国国立综合癌症网络(NCCN)指南推荐所有结直肠癌患者均应行KRAS、NRAS、BRAF基因检测[4]。目前RAS、BRAF V600E基因状态与结直肠癌临床病理特征之间的关系尚存在争议。本研究通过分析结直肠癌组织中KRAS、NRAS及BRAF V600E基因突变情况,探讨其与结直肠癌临床病理特征的关系,以期为结直肠癌患者制定个体化治疗方案提供参考。

1 资料与方法
1.1 研究对象

纳入标准:(1)经术后病理检查确诊结直肠癌;(2)术前未行任何治疗;(3)临床病理资料完整。排除标准:(1)合并炎症性肠病或其他部位原发恶性肿瘤;(2)临床病理资料缺失。回顾性收集山西省肿瘤医院2020年1月至2021年12月经手术切除并经病理检查证实的217例结直肠癌患者资料,对其手术切除标本行KRAS、NRAS及BRAF V600E基因检测。患者年龄(60±12)岁,范围22~88岁;193例单纯行结直肠癌根治术,15例行结直肠癌根治术及同期肝转移灶切除术,6例在结直肠癌局部根治术后6个月内行肝转移灶切除术,3例在结直肠癌局部根治术后6个月内行肺转移灶胸腔镜切除术。本研究经我院医学伦理委员会批准(批准文号:201763),所有患者、家属均签署知情同意书。

1.2 基因检测方法

所有病理标本均经10%甲醛溶液固定12~24 h,石蜡包埋。将石蜡包埋的肿瘤组织8 μm厚切片,取4~8张放入EP管中用于DNA提取。严格按照FFPE样品DNA分离试剂盒(德国Qiagen公司)说明书,经过脱蜡、裂解、消化、修复、吸附、洗脱等步骤,提取基因组DNA,用核酸蛋白测定仪测定DNA纯度和浓度,调整DNA浓度2~3 ng/μl,-20 ℃保存备用。

人类KRAS、NRAS、BRAF基因突变联合检测试剂盒购自北京鑫诺美迪基因公司。按照说明书,以提取的基因组DNA为模板,采用聚合酶链反应(PCR)方法进行基因扩增。取5 μl PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,紫外线分析仪观察电泳结果。取PCR纯化产物0.5 μl,加入NaAc、乙醇,离心半径9.5 cm、13 500 r/min 4 ℃离心30 min,待乙醇挥发后加入Hi-Di,溶解DNA,应用PCR仪(新加坡ThermoFisher Scientific公司)进行变性翻译,于96孔板点样,使用ABI-3130xl基因测序仪(日本ABI公司)测序,检测包括KRAS、NRAS基因第2、3、4号外显子及BRAF基因的V600E位点的体细胞突变情况。

1.3 统计学方法

采用SPSS 22.0软件进行统计学分析。计量资料符合正态分布,以±s表示;计数资料以频数(%)表示,组间比较采用χ2检验或Fisher确切概率法。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果
2.1 患者临床病理特征

217例结直肠癌患者中,男性125例(57.6%),女性92例(42.4%);年龄<60岁103例(47.5%),≥60岁114例(52.5%);右半结肠癌42例(19.4%),左半结肠癌43例(19.8%),直肠癌132例(60.8%);肿瘤长径(4.7±1.7)cm,范围1~12 cm,肿瘤长径<4.5 cm者120例(55.3%),≥4.5 cm者97例(44.7%);腺癌202例(93.1%),黏液腺癌15例(6.9%);分化程度:中高分化161例(74.2%),低分化56例(25.8%);T1~2期48例(22.2%),T3期60例(27.6%),T4期109例(50.2%);淋巴结未转移109例(50.2%),淋巴结转移108例(49.8%);未远处转移193例(88.9%),远处转移24例(11.1%);无血管瘤栓/神经侵犯160例(73.7%),血管瘤栓/神经侵犯57例(26.3%);TNM分期:Ⅰ~Ⅱ期101例(46.5%),Ⅲ~Ⅳ期116例(53.5%)。

2.2 患者RAS、BRAF V600E基因突变特点

217例手术切除标本均进行了KRAS、NRAS、BRAF V600E基因检测。(1)KRAS基因突变105例,突变率48.4%,以第2号外显子突变最常见,其基因突变率为43. 8%(95/217)。第2号外显子中第12号密码子突变率为30.4%(66/217),分别为GGT>GAT突变28例,GGT>GTT突变15例,GGT>GCT突变3例,GGT>TGT突变12例,GGT>AGT突变6例,双突变(GGT>GTT和GGT>GAT)2例。第2号外显子第13号密码子突变率为13.4%(29/217),均为GGC>GAC。第3号外显子和第4号外显子基因突变率均为2.3%(5/217)。(2)NRAS基因突变9例,突变率4.1%,其中第2号外显子突变4例(1.84%),第3号外显子突变5例(2.3%),未发现第4号外显子突变。(3)BRAF V600E突变8例,突变率3.7%。(4)1例(0.5%)患者存在KRAS和NRAS联合突变。

2.3 RAS、BRAF V600E基因突变与患者临床病理特征的关系

(1)年龄≥60岁结直肠癌患者KRAS基因突变率高于<60岁患者,差异有统计学意义(P=0.033);其他临床病理特征亚组患者KRAS基因突变率差异均无统计学意义(均P>0.05)(表1)。(2)伴远处转移的结直肠癌患者BRAF V600E基因突变率高于无远处转移患者,差异有统计学意义(P=0.006);其他临床病理特征亚组患者BRAF V600E基因突变率差异均无统计学意义(均P>0.05)(表1)。(3)所有临床病理特征亚组患者NRAS基因突变率差异均无统计学意义(均P>0.05)(表1)。

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表1

不同临床病理特征结直肠癌患者KRAS、NRAS、BRAF V600E基因突变情况比较[例(%)]

表1

不同临床病理特征结直肠癌患者KRAS、NRAS、BRAF V600E基因突变情况比较[例(%)]

临床病理特征例数KRAS基因突变χ2PNRAS基因突变PaBRAF V600E基因突变Pa
年龄(岁)        
 <6010342(40.8)4.550.0334(3.9)1.0005(4.9)0.482
 ≥ 6011463(55.3)5(4.4)3(2.6)
性别        
 男性12561(48.8)0.020.8877(5.6)0.3083(2.4)0.288
 女性9244(47.8)2(2.2)5(5.4)
肿瘤长径(cm)        
 <4.512055(45.8)0.700.4024(3.3)0.5183(2.5)0.471
 ≥ 4.59750(51.5)5(5.2)5(5.2)
肿瘤部位        
 右半结肠4223(54.8)1.270.5301(2.4)0.7062(4.8)0.269
 左半结肠4322(51.2)1(2.3)3(7.0)
 直肠13260(45.5)7(5.3)3(2.3)
病理类型        
 腺癌20298(48.5)0.020.8909(4.5)1.0006(3.0)0.098
 黏液腺癌157(46.7)0(0)2(13.3)
分化程度        
 中高分化16179(49.1)0.120.7338(5.0)0.4526(3.7)1.000
 低分化5626(46.4)1(1.8)2(3.6)
血管瘤栓/神经侵犯        
 5730(52.6)0.560.4555(8.8)0.2472(3.5)0.934
 16075(46.9)4(2.5)6(3.8)
浸润深度        
 T1~24826(54.2)2.520.2881(2.1)0.2110(0)0.354
 T36024(40.0)5(8.3)3(5.0)
 T410955(50.5)3(2.8)5(4.6)
淋巴结转移        
 10857(52.8)1.660.1984(3.7)0.7485(4.6)0.499
 10948(44.0)5(4.6)3(2.8)
远处转移        
 2415(62.5)2.150.1420(0)0.6024(16.7)0.006
 19390(46.6)9(4.7)4(2.1)
TNM分期        
 Ⅰ~Ⅱ期10144(43.6)1.760.1854(4.0)1.0001(1.0)0.070
 Ⅲ~Ⅳ期11661(52.6)5(4.3)7(6.0)

注:a采用Fisher确切概率法

3 讨论

KRAS和NRAS是由RAS家族成员基因编码的两种GTP酶蛋白,参与表皮生长因子受体(EGFR)的信号转导,调控细胞生长、分化、增殖和存活。BRAF基因为RAF原癌基因家族成员,位于RAS基因下游,是RAS-RAF-MEK激酶通路上的关键成员。结直肠癌患者基因突变率受检测方法、包含的基因位点、样本量的大小及人种的影响[5]。文献[6]报道40%~50%的结直肠癌患者存在KRAS基因点突变,3.8%~7.0%结直肠癌患者存在NRAS基因点突变。在亚洲结直肠癌患者中,BRAF突变率为5.4%~6.7%[7],其中V600E突变占80%以上,是最常见的BRAF基因激活突变[8]。本研究中KRAS基因突变率为48.4%,为结直肠癌主要的突变基因,其中第2号外显子突变率最高,占KRAF基因总突变的90.5%(95/105),突变位点主要发生在第2号外显子的第12、13位密码子上[9,10],GGT>GAT和GGC>GAC是最常见的突变类型。本研究中NRAS基因突变率为4.1%,与文献报道基本一致;BRAF V600E突变率为3.7%,略低于文献报道,可能与检测的基因位点类型不同有关。

文献报道中结直肠癌患者KRAS基因突变与临床病理特征的关系的结果差异较大,争议的焦点主要集中在肿瘤位置、性别和年龄上。左、右半结肠癌及直肠癌由于存在胚胎起源、解剖学供应、遗传学及细胞分子特征上的差异,导致二者流行病学和致癌机制不同、靶向治疗效果及预后各异[11,12]。有研究结果显示右半结肠癌KRAS基因突变率明显高于左半结肠癌[13],本研究中KRAS基因突变率在左、右半结肠癌及直肠癌中分别为51.2%、54.8%、45.5%,差异无统计学意义(P<0.05)。由于右半结肠管腔较宽、距肛缘较远,早期肿瘤不易被发现,导致右半结肠癌体积大、分化差、分期晚、预后差,而与基因状态无相关性[11,14]。本研究中年龄≥60岁结直肠癌患者KRAS基因突变率(55.3%)明显高于年龄<60岁患者(40.8%)(P<0.05),与多数研究一致[5,15,16],故年龄分层可考虑作为KRAS基因状态无法明确时靶向治疗选择的参考依据[16]。有研究者认为RAS-RAF-MAPK通路可能与性激素相关[17],KRAS基因突变更易发生于女性患者[18]。本研究KRAS基因突变率在不同性别患者中并无差异,可能与样本选择及人种、地域差异有关。

NCCN结直肠癌诊治指南2019.V1版将BRAF基因与KRAS、NRAS基因提到了同等地位。BRAF V600E突变可导致RAF-MAPK信号通路的持续性激活,引起肿瘤细胞分化、增殖、代谢、生长的改变[9]。研究证实BRAF V600E突变预示着患者不良预后和高复发风险[19];Margonis等[20]分析了849例患者数据发现,与KRAS基因突变相比,BRAF V600E突变对总生存和无病生存的影响至少增加3倍。本研究中BRAF V600E突变率较低,但伴随远处转移的结直肠癌患者BRAF V600E突变率(16.7%)明显高于无远处转移患者(2.1%)(P<0.05),Ⅲ~Ⅳ期结直肠癌患者BRAF V600E突变率(6.0%)高于Ⅰ~Ⅱ期患者(1.0%),但差异无统计学意义(P=0.070),提示BRAF V600E突变的患者肿瘤恶性程度可能更高,预后较差,与文献报道基本一致。

尽管关于NRAS基因突变的研究较少,但多中心临床试验证实了NRAS基因突变也是西妥昔单抗治疗产生耐药的一种分子标志物,NRAS基因突变的结直肠癌患者不能从抗EGFR药物中获益[21]。Pikoulis等[22]研究显示NRAS基因突变与患者性别相关,男性NRAS基因突变率高于女性,提示女性结直肠癌患者更容易从抗EGFR靶向治疗中获益,其具体分子机制仍有待进一步探讨。本研究中男性NRAS基因突变率为5.6%,女性为2.2%,差异无统计学意义(P>0.05),可能是NRAS基因的突变率较低、检测的病例数还不足以显示出统计学差异所致。本研究中NRAS基因状态与性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤部位、病理类型、分化程度、浸润深度、淋巴结转移、远处转移、TNM分期、血管瘤栓/神经侵犯均无相关性,本课题组将继续增加病例,进一步研究NRAS基因状态与临床病理特征之间的关系。

总之,结直肠癌患者KRAS基因突变位点主要在第2号外显子,年龄与KRAS基因突变相关,伴远处转移与BRAF V600E基因突变相关。本研究为回顾性分析,且病例有限,结果仍有待多中心、大样本、前瞻性研究进一步验证。

利益冲突
利益冲突

所有作者均声明不存在利益冲突

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