动脉粥样硬化（atherosclerosis，AS）是指脂肪和纤维物质在动脉最内层即内膜中的累积，形成动脉壁纤维脂肪病变，通过内膜炎症、坏死、纤维化和钙化导致斑块形成，具有较高的发病率和死亡率^［1］。AS是导致颈动脉斑块形成的最常见的原因，而颈动脉斑块形成导致了大约10%~20%的脑卒中^［2］，是脑卒中发生的重要危险因素^［3］。Keyhani等^［4］发现，即使无症状的颈动脉斑块形成的患者也存在发生卒中的风险，早期对颈动脉斑块进行手术干预相比于仅通过药物治疗，5年内卒中发生率显著性减低，但仍有5.6%，这可能是由于斑块破裂导致远端栓塞所造成的。如何减少斑块破裂的风险，即如何稳定斑块，成为亟待解决的问题。对稳定性斑块转变为易损斑块的机制进行充分研究有助于解决这一问题。RNA测序技术揭示了mRNA剪接的程度^［5］以及非编码RNA^{［6, 7］}和增强子RNA^［8］对基因表达的调控。通过对差异基因表达（DGE）的分析，能够了解基因组的功能作用、研究生长发育过程和探索病理过程中的分子失调^［9］。但早期RNA测序所得到的结果包含整个组织的全部情况，无法精确地描述每个细胞表达情况，掩盖了细胞群内的转录组异质性，这使得特定细胞亚型在易损斑块中发挥的作用被掩盖。单细胞转录组测序技术（single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）作为一种对单个细胞全基因组测序的手段，能够有效地检测整个组织中每一个细胞的基因序列，分析不同亚型细胞的表达以及其在斑块稳定性中发挥的作用、不同细胞间的通讯关系。对颈动脉斑块进行scRNA-seq，能够全面描绘颈动脉粥样硬化斑块内膜的细胞图谱，并鉴定人动脉粥样硬化斑块组织每个细胞群中的分子变化，从而充分分析各种亚型细胞在稳定性斑块转化为易损斑块中的表达差异，明确颈动脉斑块形成与稳定性变化的机制，为颈动脉斑块形成选择合适的手术时机与合适的手术方式提供依据与指导。