肠道菌群通常又被称为肠道微生物群或胃肠道微生物群，是指生活在人类和其他动物(包括昆虫)的消化道中复杂的微生物群落。1958年诺贝尔生理学或医学奖获得者Dr. Joshua Lederberg提出：人体是由真核细胞与体内共生的原核细胞共同组成的"超级生物体"。通常，就一个完整的人体来说，组成人自身组织结构的真核细胞仅占细胞总数的10%，而其余90%则是原核细胞。随着研究的深入，开始有人将定殖于人体的数量庞大的微生物视为后天获得的一个重要"器官"，对人类健康发挥不可替代的作用。而在这个庞大的微生物族群之中，定殖于肠道的肠道菌群占据了极大的部分。研究表明，正常成人肠道内细菌数量为1 014个，是人体细胞总数的10倍左右^[1]。此外，肠道菌群基因组更是人类基因组编码基因数目的100~150倍^[2]。