指南与共识
高深度全基因组测序应用于胎儿结构异常的测试开发和初步实施的专家共识
中华医学遗传学杂志, 2024,41(6) : 677-684. DOI: 10.3760/cma.j.cn511374-20231017-00197
摘要

包括染色体数目异常、基因组拷贝数变异、单核苷酸变异、小片段插入缺失在内的遗传变异是胎儿发育异常和出生缺陷的主要病因。基于二代测序的全基因组测序(WGS)是新兴的遗传病检测技术,可对上述类型的变异同时进行检测。近年来,高深度(>30×)的WGS也在临床上逐渐开展,并被证明是明确胎儿发育异常遗传学病因的重要手段。为进一步推动将WGS用于胎儿异常的产前诊断,本学组组织专家参考国内外相关指南、共识和研究成果,就WGS的分析流程、报告建议及咨询内容等形成了以下共识。

引用本文: 中华医学会医学遗传学分会细胞与基因组学组, 全基因组测序应用于产前诊断的专家讨论组, 王燕菲, 等.  高深度全基因组测序应用于胎儿结构异常的测试开发和初步实施的专家共识 [J] . 中华医学遗传学杂志, 2024, 41(6) : 677-684. DOI: 10.3760/cma.j.cn511374-20231017-00197.
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2% ~ 4%的妊娠中会发生胎儿结构异常。传统的遗传学检查技术,包括染色体核型分析、荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)、拷贝数变异(copy number variation,CNV)分析等,在总体上可为30% ~ 40%的结构异常胎儿提供诊断[1,2]。近年来,应用靶向测序、全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES)等二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)对胎儿进行遗传学检测的有效性已得到证实。大型队列研究表明,对于结构异常的胎儿,WES可将染色体核型及CNV分析的诊断率提高8.5% ~ 10%[3,4,5]。然而,仍有相当比例的结构异常胎儿无法明确病因,其原因除胎儿表型不够明确以及目前对胎儿基因型与表型对应关系的认识存在局限外,还包括靶向测序及WES等技术的局限性。高深度全基因组测序(short-read whole-genome sequencing,srWGS;以下简称为WGS)能够对基因组的全部序列进行覆盖,检测范围更广,同时能够在一定程度上避免靶向测序与WES因建库等过程而造成的漏检[6,7]

 
 
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