肠道微生物在参与肿瘤的发生发展及治疗反应等方面都有重要影响，通过检测肠道菌群能够及时发现疾病相关的菌群异常，对预防和治疗疾病都有显著的意义。在针对肠道微生态组学的基础及临床研究领域，需要认识和了解肠道微生物组学的实验室检测方法。肠道微生组学检测技术的实验流程、质量管理和报告解读等方面没有统一标准，为了明确肠道微生态组学实验室标准化技术规范流程，中国抗癌协会肿瘤与微生态专业委员会和湖北省免疫学会肿瘤与微生态专业委员会组织有关专家共同讨论，提出《肠道微生态组学实验室标准化技术规范中国专家共识》，为肠道微生态组学领域的进一步深入研究提供依据。
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肠道微生态是一个庞大复杂的生态系统，是人体微生态系统的重要组成部分，肠道微生态组学研究领域已受到广泛关注，越来越多的研究基于肠道微生物对人体内各个组织器官的影响，以及与各种疾病之间的关系[1,2,3]。研究表明，人体多种疾病如肠道类病症（如便秘、腹泻、肠易激综合症、炎症性肠病）、代谢综合症（如肥胖、糖尿病）、心脑血管疾病（如高血压）、免疫相关疾病（如过敏、哮喘）、精神疾病（如自闭症）和癌症（如结直肠癌）等都与肠道菌群失调密切相关[4,5]。通过肠道菌群检测，能够及时发现疾病相关的菌群异常，并配合进行有针对性的干预和调理，是调节肠道微生态，预防菌群相关疾病发生和缓解症状的有效途径[6]。利用16S核糖体RNA（16S rRNA）基因测序、鸟枪法元基因组等分析人类相关微生物组，为预测和发现人类疾病和健康状况的生物标志物提供了丰富的微生物数据资源。越来越多的证据表明，微生物群-宿主相互作用的失调与多种疾病有关，包括炎症性肠病、结直肠癌、糖尿病和肝硬化等[7]。实体肿瘤的T细胞浸润与良好的患者预后相关，但个体间不同免疫应答的机制尚不清楚，一种可能的调节剂是肠道菌群。2013年，Science杂志首次发表肠道微生物参与调控化疗药物疗效的文章[8]。2018年1月，Science杂志再次同时发表三篇肠道菌干预抗程序性死亡受体1（programmed cell death protein 1，PD-1）疗效的临床研究[9,10,11]：肠道中的梭菌（Clostridiales）增强了PD-1抗体的疗效，而拟杆菌（Bacteroidales）抑制该治疗疗效，嗜黏蛋白艾克曼菌（Akkermansia muciniphila）可增强PD-1抗体抗肿瘤效应，揭示肠道菌群的差异是导致治疗成败的关键因素。人粪便中分离出的菌株可通过增强免疫检查点抑制剂的作用而抗结肠癌。研究证实增强免疫检查点抑制剂（PD-1抗体等）作用的是来源于人微生物的11种细菌株"组合"，其可增强对抗感染和肿瘤的免疫反应[12]。2020年8月21日，Science发表论文探讨了肠道菌群共生特异淋巴细胞促进抗肿瘤免疫应答的具体机制[13]。
