
• 综述 •
染色质靶向酶切测序技术(CUT&RUN,CUT&Tag)的发展和应用
国际遗传学杂志, 2021,44(1)
: 24-31. DOI: 10.3760/cma.j.cn231536-20200829-00077
摘要
传统的免疫共沉淀测序(ChIP-seq)是研究蛋白-染色质相互作用的主流方法,由于ChIP-seq难以在低起始细胞量和单细胞样本上实施限制了其应用范围。近年来新发展起来的染色质酶切测序技术CUT&RUN和CUT&Tag展现出操作简单,背景低,可重复性高和要求的细胞起始量低等优点,有替代ChIP-seq进行蛋白-染色质相互作用研究的潜力,并有效提高了单细胞ChIP-seq的可行性。本文将就这类靶向染色质进行酶切测序的主要技术的发展和应用现状做简要综述。
引用本文:
韦晔,
李科,
卢大儒,
等.
染色质靶向酶切测序技术(CUT&RUN,CUT&Tag)的发展和应用
[J]
. 国际遗传学杂志, 2021, 44(1)
: 24-31.
DOI: 10.3760/cma.j.cn231536-20200829-00077.
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染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitationassay,ChIP)以及衍生的染色质免疫共沉淀测序(ChIP followed by sequencing,ChIP-seq)是研究蛋白-染色质相互作用的传统方法。此方法所利用的交联后染色质免疫共沉淀(cross-link ChIP,X-ChIP)是生物学中应用最广泛的技术之一。然而,其存在的许多缺陷,如染色质免疫共沉淀操作效率低下、超声破碎对细胞数量的要求高、分辨率较低、以及甲醛交联造成的伪影或者峰的丢失等仍然制约了ChIP-seq的应用,制约了ChIP-seq的规模,使得其操作繁琐,难以用于低起始细胞量和单细胞的场景。





















