高通量测序(high-throughput sequencing)技术在感染性疾病病原学诊断及常见病原微生物的耐药诊断中优势明显，在分枝杆菌病领域也得到越来越广泛的应用，为疑难分枝杆菌病的诊断、鉴别诊断和耐药诊断提供了循证医学证据。然而在实际应用过程中，临床医师对于如何解读高通量测序结果、如何从大量数据中捕获有价值的信息、如何在诸多干扰因素存在的情况下做出正确的判断，均存在困惑。鉴于此，高通量测序共识专家组针对高通量测序技术临床使用过程中存在的突出问题，参考已发表的相关研究数据，并结合参与专家的临床使用经验形成本共识，以期提高该技术的临床应用水平，去伪存真，使这项先进的检验技术得到科学合理的应用。