简报
胶质母细胞瘤替莫唑胺耐药的共表达网络分析
中华实验外科杂志, 2020,37(6) : 1161-1161. DOI: 10.3760/cma.j.cn421213-20200120-00046
引用本文: 崔凯, 董克勤, 郭培源, 等.  胶质母细胞瘤替莫唑胺耐药的共表达网络分析 [J] . 中华实验外科杂志, 2020, 37(6) : 1161-1161. DOI: 10.3760/cma.j.cn421213-20200120-00046.
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胶质母细胞瘤(GBM)是最常见的颅内恶性肿瘤之一[1],替莫唑胺(TMZ)广泛应用于GBM治疗但多数患者出现耐药[2,3]。本研究通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究GBM患者TMZ耐药相关分子标志物及机制[4,5]

一、材料与方法

从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中选取数据集GSE7696并寻找差异表达基因(DEGs),进行WGCNA构建。对模块内的基因进行富集分析并使用蛋白互作网络筛选hub基因。受试者工作特征曲线(ROC)用于评估基因的诊断价值。通过生存分析(Kaplan-Meier法)构建生存曲线。所有分析均通过SPSS 22.0进行,以P<0.05为差异有统计学意义。

二、结果

成功构建WGCNA网络并筛选出棕色模块以进行进一步分析。对棕色模块内的基因进行富集分析并筛选出hub基因。通过ROC曲线探究hub基因的诊断效能,NKX2-2的曲线下面积最大(曲线下面积=0.757,P<0.05)与患者的总生存期和无病生存期相关。

三、讨论

胶质母细胞瘤是中枢神经系统内常见的恶性肿瘤,本文利用WGCNA初步探索了该疾病TMZ耐药的机制。富集分析中"MutLalpha complex"被显著富集,研究显示MutLalpha复合体可修复DNA碱基错配,从而导致TMZ耐药[6]。Chornokur等[7]研究显示,丝氨酸蛋白酶抑制因子肽酶抑制因子进化枝A成员7(SERPINA7)突变可增加上皮性卵巢癌(EOC)的风险,可作为判断EOC预后不良的分子标志物,本研究则发现SERPINA7与TMZ耐药相关。CD80是hub基因之一,可抵抗TMZ所致的细胞凋亡。Murray等[8]对多发性骨肉瘤化疗抵抗的研究中也指出CD80与CD28结合可抵抗细胞凋亡。人神经元特异性烯醇化酶(ENO2)可通过改变细胞代谢活性,使急性淋巴细胞白血病患者产生化疗抵抗[9]。Deng等[10]的研究中发现5羟色胺受体7(HTR7)与胶质瘤患者的不良预后显著相关,与本研究结论一致。据报道,NK2转录样蛋白B(NKX2-2)过表达和小细胞肺癌患者化疗抵抗有关[11]。本研究中,NKX2-2与GBM患者TMZ耐药相关。

本研究通过WGCNA分析了导致GBM患者TMZ耐药的hub基因及其分子机制,SERPINA7、CD80、ENO2、HTR7、NKX2-2及白蛋白(ALB)可作为GBM患者TMZ耐药的分子标志物。

利益冲突
利益冲突

所有作者均声明不存在利益冲突

参考文献
[1]
TouatMIdbaihASansonMet al.Glioblastoma targeted therapy:updated approaches from recent biological insights[J].Ann Oncol201728(7):1457-1472. DOI:10.1093/annonc/mdx106.
[2]
ChoiSYuYGrimmerMRet al.Temozolomide-associated hypermutation in gliomas[J].Neuro Oncol201820(10):1300-1309. DOI:10.1093/neuonc/noy016.
[3]
ThomasATanakaMTrepelJet al.Temozolomide in the era of precision medicine[J].Cancer Res201777(4):823-826. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-16-2983.
[4]
MaertensATranVKleensangAet al.Weighted gene correlation network analysis (WGCNA) reveals novel transcription factors associated with bisphenol a dose-response[J].Front Genet20189:508. DOI:10.3389/fgene.2018.00508.
[5]
PeiGChenLZhangWWGCNA application to proteomic and metabolomic data analysis[J].Methods Enzymol2017585:135-158. DOI:10.1016/bs.mie.2016.09.016.
[6]
ZhangMHuCMosesNet al.HDAC6 regulates DNA damage response via deacetylating MLH1[J].J Biol Chem2019294(15):5813-5826. DOI:10.1074/jbc.RA118.006374.
[7]
ChornokurGLinHYTyrerJPet al.Common genetic variation in cellular transport genes and epithelial ovarian cancer (EOC) risk[J].PLoS One201510(6):e0128106. DOI:10.1371/journal.pone.0128106.
[8]
MurrayMEGavileCMNairJRet al.CD28-mediated pro-survival signaling induces chemotherapeutic resistance in multiple myeloma[J].Blood2014123(24):3770-3779. DOI:10.1182/blood-2013-10-530964.
[9]
LiuCCWangHWangWDet al.ENO2 promotes cell proliferation,glycolysis,and glucocorticoid-resistance in acute lymphoblastic leukemia[J].Cell Physiol Biochem201846(4):1525-1535. DOI:10.1159/000489196.
[10]
DengLXiongPLuoYet al.Bioinformatics analysis of the molecular mechanism of diffuse intrinsic pontine glioma[J].Oncol Lett201612(4):2524-2530. DOI:10.3892/ol.2016.5024.
[11]
LawsonMHCummingsNMRasslDMet al.Two novel determinants of etoposide resistance in small cell lung cancer[J].Cancer Res201171(14):4877-4887. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-11-0080.
 
 
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