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基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂
国际医药卫生导报, 2022,28(9)
: 1204-1208. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2022.09.005
摘要
目的
采用分子对接技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂。
方法
研究时间为2021年1月至9月。基于过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARγ）的PDB晶型结构（PDB Code：6md4），构建虚拟靶标模型，以天然产物数据库中的1 680个化合物为配体筛选对象，以6md4原配体分子为对照。首先采用SYBYL软件对天然小分子化合物进行虚拟筛选，随后对排名前20位的化合物进行高精度分子对接，最后再使用PyMol软件分析结合稳定的化合物。
结果
根据评分结果并结合冲突、极性和相似度，最终筛选出橙皮苷等20个小分子PPARγ激动剂，其中橙皮苷能够与PPARγSer289、His323、Tyr327等多个氨基酸形成氢键，结合良好。
结论
从天然产物中筛选出潜在的PPARγ激动剂，为发现新型抗糖尿病的先导化合物或膳食补充剂提供基础。
引用本文:
刘治国,
崔文强,
魏叶,
等.
基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂
[J]
. 国际医药卫生导报, 2022, 28(9)
: 1204-1208.
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2022.09.005.
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过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARγ）在脂肪细胞分化、葡萄糖稳态和胰岛素敏感性等糖脂代谢方面中发挥着重要作用。噻唑烷二酮类药物（TZDs），如罗格列酮和吡格列酮，是合成的PPARγ激动剂，主要用于治疗2型糖尿病。虽然此类药物产生的不良反应限制了其临床应用，但TZDs目前仍然是临床上用于改善胰岛素抵抗的重要药物。近年研究发现天然产物具有较好的抗糖尿病活性且几乎没有副作用，因此从植物来源的天然化合物库中寻找潜在的药物先导化合物或膳食补充剂成为研究热点。PPARγ是抗糖尿病药物非常有吸引力的分子靶标，因此寻找新的PPARγ激动剂以增强其有益作用并减少不良反应仍有很高的研究价值。
