肝癌
piRNA在肝细胞癌组织中的差异表达分析
中华肝脏病杂志, 2018,26(11) : 842-846. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2018.11.007
摘要
目的

探讨piRNA在肝细胞肝癌发生、发展中的作用。

方法

对肝癌患者的癌及癌旁组织、转移及非转移的肝癌组织进行小RNA二代测序,将测序数据过滤掉常见RNA序列后去重复;用piRNA预测器预测可能的新piRNA,并和下载的已知piRNA合并,筛选得到差异明显的piRNA。以miranda算法预测相应靶基因,并对其进行富集分析和功能预测,并选取piRNA在LM3和PLC细胞中行进一步功能(迁移能力)实验及分析。两组间均数比较采用独立样本t检验。

结果

测序共获得66 772个piRNA(已知149个),发现癌和癌旁组织表达差异明显的有241个piRNAs,转移和非转移肿瘤组织表达差异明显的1 634个piRNAs。对差异piRNA的靶基因进行GO和KEGG通路分析,发现主要和细胞黏附相关。而对选取的一个piRNA(piR1/97)进行功能实验,显示其促进肝癌细胞的迁移(LM3:t = 8.829,P < 0.05;PLC: t = 7.318,P < 0.05)。

结论

piRNA在肝细胞肝癌患者的癌及癌旁组织、转移及非转移患者的肝癌组织中表达量有差异,并可能参与肝细胞肝癌的转移过程,更多的功能分析需要进一步研究和实验确证。

引用本文: 缪沛真, 杨怡, 陈二宝, 等.  piRNA在肝细胞癌组织中的差异表达分析 [J] . 中华肝脏病杂志, 2018, 26(11) : 842-846. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2018.11.007.
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piRNA(piwi-interacting RNA)是一种与PIWI蛋白相互作用、长度为26~33 nt的非编码小RNA,常见功能为通过抑制转座而维持生殖细胞的稳态[1,2,3]。近几年,piRNA在生殖系统以外的表达和功能方面的研究日益增多[4]。目前,已发现在多种癌症中piRNA可能参与肿瘤的发生、进展,如胃癌、肾癌、肺癌、乳腺癌等[5,6,7,8]。其中,初步研究数据表明piRNA与肝癌的进展也可能有关,但并没有相关的深入研究[9]

 
 
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