群体遗传学研究
深圳地区汉族献血人群MICA等位基因多态性及其与HLA-B基因的连锁不平衡分析
中华医学遗传学杂志, 2018,35(5) : 747-752. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2018.05.030
摘要
目的

研究主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A位点(major histocompatibility complex class I chain-related gene A,MICA)在深圳地区汉族献血人群中的分布特点及其与人类白细胞抗原B位点(human leukocyte antigen locus B,HLA-B)基因的连锁不平衡关系。

方法

采用基于聚合酶链反应-碱基序列直接测序(PCR-sequence based typing,PCR-SBT)方法对143名随机深圳地区汉族献血者进行MICAHLA-B基因高分辨分型,并采用Pypop软件分析等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数。

结果

143名献血者标本中共检出了13个MICA和35个HLA-B等位基因,其中MICA*008:01频率最高(76/286);MICA*008:01-HLA-B*40:01和MICA*010-HLA-B*46:01是最常见的单倍型。

结论

获得了深圳地区汉族献血人群MICAHLA-B基因的等位基因和单倍型多态性及连锁不平衡分析数据,列出了部分MICAHLA-B等位基因及单倍型频率,为MICAHLA-B基因的相关研究和应用提供了参考数据。

引用本文: 王宋兴, 徐筠娉, 何柳媚, 等.  深圳地区汉族献血人群MICA等位基因多态性及其与HLA-B基因的连锁不平衡分析 [J] . 中华医学遗传学杂志, 2018, 35(5) : 747-752. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2018.05.030.
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主要组织相容性复合物Ⅰ类相关基因(major histocompatibility complex class Ⅰchain-related gene,MIC)A位点是MIC基因家族的成员。MIC是位于主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC)-Ⅲ类基因区长度为2 Mb的一组免疫功能相关基因,由Bahram等[1]首先发现,MIC包括MICAMICBMICCMICDMICEMICFMICG 7个位点,其中MICAMICB为功能基因,其余均为假基因。MIC基因与经典MHC-Ⅰ类基因具有较高的同源性,其分子结构与经典MHC-Ⅰ类分子有30%的同源性。MICA基因是HLA-B最近的邻居,距HLA-B着丝粒端仅40 kb。MICA基因包含6个外显子,第1外显子编码前导肽,第2、3、4外显子分别编码3个细胞外结构域α1、α2、α3,第5外显子编码跨膜区,第6外显子编码细胞质尾。MICA基因主要表达于上皮细胞,可与CD8+T淋巴细胞及自然杀伤(natural killer, NK)细胞表面的激活性受体NKG2D相互作用介导细胞毒作用[2]。因此,肿瘤细胞可通过降低MICA基因的表达从而逃逸T细胞与NK细胞的免疫监视[3]。与HLA-Ⅰ类基因相似,MICA基因也具有丰富的多态性,且同种异型的MICA具有较强的免疫原性。国外大量的研究和临床实验表明,在兼顾经典HLA配型的同时,如果MICA基因亦匹配,器官移植后受体生存率将明显提高。Zou等[4]发现,在发生移植排斥的患者血清中存在的MICA抗体与移植后排斥反应的发生具有明确的相关性。因此,了解MICA基因的多态性并在器官移植前对供、患者进行MICA基因的配型具有一定的意义。在群体遗传学中,MICAHLA-B基因的分布与地域和种族等因素有关,目前尚未见到深圳地区汉族人群的MICA的多态性研究报道。我们通过采用基因测序分型方法对143名随机的深圳地区汉族献血者标本进行MICAHLA-B高分辨分型,并分析其等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡关系,现将研究结果报告如下。

 
 
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