病例报告
X染色体微重复一例
中华医学遗传学杂志, 2021,38(2) : 201-202. DOI: 10.3760/cma.j.cn511374-20191128-00610
引用本文: 王学韬, 雷梅芳, 林书祥, 等.  X染色体微重复一例 [J] . 中华医学遗传学杂志, 2021, 38(2) : 201-202. DOI: 10.3760/cma.j.cn511374-20191128-00610.
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患儿 女,7岁4个月,确诊癫痫3年余,表现为无热抽搐、全身强直发作。体格检查:身高110 cm,体重15.3 kg(均相当于第3百分位),头围49.5 cm。体型消瘦,神志清楚,外观无明显畸形,四肢肌力及肌张力正常。家系调查:患儿有一弟,5月龄,表型正常。母亲无不良孕产史。父母体健,系非近亲结婚,否认抽搐、智力低下以及遗传代谢病家族史。患儿目前每天抽搐多次,均表现为意识模糊、双眼凝视、口唇发绀、全身强直发作。除首次抽搐时伴有38℃发热外,其余均不伴发热。

实验室检查:脑电图示左侧中颞区不规则尖波、尖慢波,可波及同侧前后颞区。脑电图检测中患儿抽搐1次,同期脑电图见广泛高电位尖慢、棘慢、多棘慢综合波发放。头颅磁共振成像提示髓鞘化延迟。垂体高度约4 mm。尿气相色谱-质谱筛查未见明显异常。智力量表测量提示为正常边缘水平。

细胞遗传学检查:在征得其父母知情同意后采集血样,常规进行外周血淋巴细胞培养,染色体制备,G显带分析,患儿核型为46,X,Xq+(图1)。其父母核型均未见异常。高通量测序未发现患儿携带相关致病的微小变异。基于二代测序进行拷贝数变异分析(copy number variantion sequencing, CNV-seq)提示患儿Xq22.1q23区存在约15.30 Mb的重复([hg19]99 551 265-115 594 027×3)(图2)。检索DECIPHER数据库,其重复片段所包含的基因如图3。本研究经天津市儿童医院伦理学委员会批准(2016021)。

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图1
患儿外周血核型为46,X,Xq+ 箭头示异常的X染色体
图2
CNV-seq的检测结果 患儿携带Xq22.1q23(99 551 265-115 594 027[hg19])重复,范围约15.30 Mb(红色区域)
图3
患儿染色体微重复区域在DECIPHER数据库中的查询结果 其重复区包含若干功能基因和已报道的致病性拷贝数变异
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图1
患儿外周血核型为46,X,Xq+ 箭头示异常的X染色体
图2
CNV-seq的检测结果 患儿携带Xq22.1q23(99 551 265-115 594 027[hg19])重复,范围约15.30 Mb(红色区域)
图3
患儿染色体微重复区域在DECIPHER数据库中的查询结果 其重复区包含若干功能基因和已报道的致病性拷贝数变异
讨论

Xq22.1-Xq23重复既往报道很少,其范围涵盖PLP1、DCX、PAK3、PCDH19等功能基因。PCDH19的变异可导致癫痫性脑病9型,其特征为婴儿期癫痫发作、智力障碍、发育迟缓。首次发作年龄平均为14个月。该病仅影响杂合子女性[1]。有报道携带PCDH19变异的女性有自闭症的表现[2],且部分患者智力处于正常边缘水平[3]。Hirabayashi等[4]曾报道1例携带Xq21.32-q22.1区6.69 Mb缺失的患者,其缺失区涵盖PCDH19基因,表现为全身强直性癫痫发作。本例患儿的重复片段亦涵盖PCDH19基因,但文献中尚无类似重复致病的报道。患儿起病相对较晚,且无自闭症表现,其机制尚待进一步的研究。

PLP1基因与佩梅病(Pelizaeus-Merzbacher disease,PMD)相关。该病常见于男性,女性多为携带者。本例患儿的表现与PMD不符,亦不同于DCX、PAK3等其他功能基因变异所导致的表型。DECIPHER数据库收录有3例与本例患儿相似的重复片段,但其表型不尽相同。

相比于传统的染色体核型分析,CNV-seq分析可以更精确地定位大片段的缺失或重复,明确所涉及的关键基因,有利于快速、高效的诊断。

利益冲突
利益冲突

所有作者均声明不存在利益冲突

参考文献
[1]
陈奕杨小玲刘爱杰. PCDH19基因变异导致女性癫痫患儿的临床特点[J]. 中华儿科杂志2019, 57(11): 857-862. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0578-1310.2019.11.008.
ChenY, YangXL, LiuAJ, et al. Clinical characteristics of PCDH19-female limited epilepsy[J]. Chin J Pediatr, 2019, 57(11): 857-862. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0578-1310.2019.11.008.
[2]
JamalSM, BasranRK, NewtonS, et al. Novel de novo PCDH19 mutations in three unrelated females with epilepsy female restricted mental retardation syndrome[J]. Am J Med Genet A, 2010, 152A(10): 2475-2481. DOI: 10.1002/ajmg.a.33611.
[3]
DibbensLM, KneenR, BaylyMA, et al. Recurrence risk of epilepsy and mental retardation in females due to parental mosaicism of PCDH19 mutations[J]. Neurology, 2011, 76(17): 1514-1519. DOI: 10.1212/WNL.0b013e318217e7b6.
[4]
HirabayashiK, UeharaDT, AbeH, et al. Copy number variation analysis in 83 children with early-onset developmental and epileptic encephalopathy after targeted resequencing of a 109-epilepsy gene panel[J]. J Hum Genet, 2019, 64(11): 1097-1106. DOI: 10.1038/s10038-019-0661-x.
 
 
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